每四个文件连接一次，Linux

我有两个存储有文件名列表的文件：

FileA:
GSM1328513
GSM1328514
GSM1328515
GSM1328516
GSM1328545
GSM1328546
GSM1328547
GSM1328548
GSM1328609
GSM1328610
GSM1328611
GSM1328612

and:
FileB:
    Brn
    Hrt
    Lng 

我要做的是，将文件A中列出的每四个文件连接起来，并将连接的文件命名为文件B中列出的文件名： 要手动执行此操作，它看起来像：

cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > Brn
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > Hrt
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > Lng

因为我有一长串的文件，我想自动完成，有人能帮忙吗。

---

如果有什么不清楚的地方，请指出。

这是执行您想要执行的操作的Shell脚本

iter=0
while read filename
do
    stop=`expr \( $iter + 1 \) \* 4`
    iter=`expr $iter + 1`
    files=`head -n $stop fileA | tail -n 4 | tr '\n' ' '`
    cat $files > $filename
done < fileB

iter=0
读取文件名时
做
stop=`expr\（$iter+1\）\*4`
iter=`expr$iter+1`
files=`head-n$stop fileA | tail-n4 | tr'\n''`
cat$files>$filename
完成

一个衬里：

cat FileA | sed 'N;N;N;s/\n/ /g;s/^/cat /;s/$/ >/;' | paste - FileB | bash

您可以通过删除最后一个管道到

bash

来测试实际生成的命令

对于

FileA

的每一行，获取下三行

N

，将换行

\N

转换为空格

，在

cat

前面加上前缀，然后追加

。然后将生成的每一行

-

与

文件B

中的一行合并。将这些命令发送到

bash

---

甚至更短的

sed

，在单个replace命令中添加了

cat

和

cat FileA | sed 'N;N;N;s/\n/ /g;s/.*/cat & >/;' | paste - FileB | bash

---

另一种不用sed的快捷方式：

cat FileA | while read a ; do read b ; read c ; read d ;
    echo "cat $a $b $c $d > " ; done | paste - FileB | bash

正如Didier Trosset所说，您可以跳过

| bash

，查看它在执行之前做了什么

其他方法：一条不带eval的班轮，将@dshepherd解决方案与矿山相结合：

cat FileA | xargs -n4 echo | paste - FileB | while read a b c d e ; do cat $a $b $c $d > $e ; done

---

优点：到目前为止，这是唯一一个不求值任何输出（

|bash

）且不使用临时文件的线性程序，并且只使用随处可见的标准工具（

cat

，

xargs

，

粘贴

）。

另一种方法：您可以使用

cat FileA | xargs -n4 echo

然而，我想不出任何特别优雅的方式将其与FileB的输出文件名结合起来。一种可能是进行一些字符串操作，然后对其进行求值（如Didier Trosset的答案）

编辑：明白了！使用GNU并行（类似于类固醇上的xargs）：

parallel

parallel

命令对每组4个参数运行cat，并将输出放入临时文件中。它将这些临时文件的名称写入标准输出（并且

-k

表示它们以正确的顺序写入）

paste

将所需的文件名插入流中，然后我们只需使用

xargs-n2 mv

将临时文件移动到所需的位置

我使用了

而不是

cat tempA

，因为从技术上讲它很简单

---

在我看来，与其他单行程序相比，这种方法的优点是不必求值字符串（例如，使用

bash

）。

使用

awk

：

awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash

或者，在第一步中使用

dshepherd

方法：

xargs -n4 echo < FileA | awk '{print "cat "$0" >"}' | paste - FileB | bash

---

说明：

使用

awk

，将每组四行组成一行。 如果记录编号，

RN

为模四，则用新行

“\n”

分隔，否则为单个空格

”

。 这将产生以下输出：

$ awk '{ORS=(NR%4?" ":"\n")}1' FileA
GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516
GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548
GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612

正如

dshepherd

所建议的，使用

xargs

更容易做到这一点：

$ xargs -n4 < FileA
GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516
GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548
GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612

使用

粘贴-FileB

（

-

意思是从标准输入中获取）将这些行与

文件b

中的行连接起来

$ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB
cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 >   Brn
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 >   Hrt
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 >   Lng

---

---

使用

bash

数组（

bash

4或更高版本是必需的）

fileB

中的名称数与

fileA

中的名称数匹配

readarray -t gsms < FileA
for ((i=0; i<${#gsms[@]}; i+=4)); do
    read fname
    echo "${gsms[@]:i:4}" > "$fname"
done < FileB

readarray-t gsms

您也可以在末尾使用

粘贴
：
cat FileA | xargs-n4 echo cat | paste-d'>'-FileB | bash
。我认为这是最短的答案：）我真的很想找到一个不涉及字符串求值的单行程序，但我想不出怎么做。我认为我们需要某种方法将独立的参数列表传递给
xargs
，但你不能……我同时想出了另一种方法！：）您的方法可能更简单。我需要开始使用
，而
循环更多。
$ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' 
cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 > 
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 > 
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 > 

$ xargs -n4 < FileA | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB
cat GSM1328513 GSM1328514 GSM1328515 GSM1328516 >   Brn
cat GSM1328545 GSM1328546 GSM1328547 GSM1328548 >   Hrt
cat GSM1328609 GSM1328610 GSM1328611 GSM1328612 >   Lng

xargs -n4 < FileA  | awk '{print "cat "$0" > "}' | paste - FileB | bash

readarray -t gsms < FileA
for ((i=0; i<${#gsms[@]}; i+=4)); do
    read fname
    echo "${gsms[@]:i:4}" > "$fname"
done < FileB