Linux '；意外的文件结尾'；和'；导入函数定义时出错'；使用qsub运行shellscript时出错

我有以下shell脚本：

#!/bin/sh
cd /sw/local/bin/
export LD_LIBRARY_PATH=/sw/local/lib:/usr/local/Trolltech/Qt-4.7.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH
./FeatureFinderRaw -in /homes/JG-C1-18.mzML -out /homes/test_remove_after_use.featureXML -threads 20

当我从自己的命令行运行它时，它工作正常，但当我尝试执行以下操作时：

qsub -q ningal.q -cwd -V -o /homes/queue.out -e /queue.err featureFind_C1-18_20t.sh 

我得到以下错误：

/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `module'
./FeatureFinderRaw: error while loading shared libraries: libOpenMS.so: cannot open shared object file: No such file or directory
/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `module'
./FeatureFinderRaw: error while loading shared libraries: libQtWebKit.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `module'
./FeatureFinderRaw: error while loading shared libraries: libQtWebKit.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
/bin/bash: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/bash: error importing function definition for `module'
./FeatureFinderRaw: error while loading shared libraries: libQtWebKit.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `module'
./FeatureFinderRaw: error while loading shared libraries: libQtWebKit.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `module'

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我不明白为什么在使用qsub时会出现这个错误，但在同一台集群计算机上直接运行脚本时却不会。如何使用qsub运行脚本？

出于某种我不知道的原因，在每行末尾添加分号修复了该问题

最有可能的原因是，如果添加分号会产生影响，则保存文件时使用DOS行结尾（\r\n）而不是POSIX行结尾（\r）。

在/usr/share/Modules/init/bash中注释掉了“export-f module”行

在普通的登录shell中，modules.sh将从profile.d调用 模块命令可用。在非登录shell中，如应用程序 包装器脚本它只需首先获取上述文件的源代码

通常，在应用程序脚本中，在寻源上述文件后，它们再次发出命令“模块加载应用程序/供应商/应用程序”，这意味着额外寻源

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参考：-

在使用

qsub -shell no -b yes -cwd -V somescript.bash arg1 arg2 etc

如果您使用它提交另一个bashshell脚本。它产生注释

/bin/sh: module: line 1: syntax error: unexpected end of file
/bin/sh: error importing function definition for `BASH_FUNC_module'

（这是运行在CentOS 6.6上的Sun Grid Engine 211.11）通过简单地将以下内容放在包装脚本（而不是包装脚本）的顶部，就可以解决问题：

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就这些

将下面的命令添加到~/.bash_配置文件或~/.bashrc文件中，然后再次注销/登录

unset module

或简单的快速运行命令：

echo "unset module" >> ~/.bash_profile && source ~/.bash_profile

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我运行了dos2unix，这没什么区别。另外，我在linux上编写了它，当我在同一个linux集群上运行它而不使用qsub时，它就可以工作了？（这里有同样的问题）。在shell脚本的末尾没有

echo "unset module" >> ~/.bash_profile && source ~/.bash_profile