Matlab 如何将nii格式文件转换为二维图像

我有一个扩展名为.nii的文件。我不知道如何将.nii文件转换为2D格式。我的问题是，在将.nii文件转换为2D格式时，是否丢失了有关该文件的一些信息。哪种格式好？dicom或png或bmp

nii = load_nii('im.nii');
size(nii.img);

返回

ans =

    39   305   305  

它是uint8格式的

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我可以使用挤压还是调整大小？如何将调整大小应用于此图像；是否丢失信息？

是的，您可以像处理任何数组一样处理图像/序列

下面是一个简单的例子，数据来自NIH

数据集为4D格式，命名为“filtered_func_data.nii”

让我们加载数据集并访问结果结构的

img

字段：

S = load_nii('filtered_func_data.nii')

此处，S是具有以下字段的结构：

S = 

           hdr: [1x1 struct]
      filetype: 2
    fileprefix: 'filtered_func_data'
       machine: 'ieee-be'
           img: [4-D int16]
      original: [1x1 struct]

我们可以通过

img

字段访问图像数据（您已经知道了）：

如果我们检查尺寸，我们得到：

size(A)

ans =

    64    64    21   180

因此，数据集由64x64个图像组成，深度/切片数为21，帧数为180

在这一点上，我们可以操纵

A

，因为我们喜欢重塑、调整大小或任何东西

下面是一个简单的代码（动画gif），用于循环4D阵列中第一个时间点的每个片段：

NumSlices = size(A,3)

figure(1)
filename = 'MRI_GIF.gif';

for k = 1:NumSlices

    imshow(A(:,:,k,1),[])
    drawnow

    frame = getframe(1);
    im = frame2im(frame);
    [imind,cm] = rgb2ind(im,256);
    if k == 1;
        imwrite(imind,cm,filename,'gif', 'Loopcount',inf);
    else
        imwrite(imind,cm,filename,'gif','WriteMode','append');
    end

    pause(.1)
end

输出：

这对我来说很好

因此，在您的例子中，您得到的大小是

[39 305]

，您可以应用与我在处理数据集时所做的相同的操作，该数据集是三维的

编辑 与您的数据相同：

S = load_nii('Subject01.nii');

A = S.img;

NumSlices = size(A,3);

然后，如果想要二维图像，需要在三维阵列中选择一个切片

例如，第一个切片的访问方式如下：

A(:,:,1)

其余的就这样

要将图像另存为png，请使用

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希望有帮助

是的，看起来像。虽然看起来305x305更有意义，但您可以尝试排列数据集并显示它以确保。切片的数量是第三维的，因此在本例中，它看起来像它的305。这看起来很奇怪，但如果图像是305x305，有39个切片，它会更有意义。你可以把它放在一个托管网站上，如果你想的话我会看看。嗯，我可能会想到Dropbox或Google Drive？好吧，我试过你的数据，效果很好。我将编辑我的答案。我想将此图像转换为二维

A(:,:,1)