使用MPI在顺序和并行之间切换_Mpi

使用MPI在顺序和并行之间切换

mpi

使用MPI在顺序和并行之间切换,mpi,Mpi,我有一个代码可以计算一些导体的热传递。一个导体中发生的情况不会影响模型中的其他导体。因此，我试图使这些导体的解决方案并行运行，每个处理器采用一组不同的导体。现在，我认为代码可以在一个内核上运行，直到它到达这个循环，我在其中放置了命令： MPI_INIT MPI_FINALIZE 然后在我请求的多个内核上运行这段代码，然后在命令后返回到在一个内核上运行： MPI_INIT MPI_FINALIZE 遇到了。但我看到的是，输入文件由两个内核读取（如果我使用2个内核），所有输出也打印两次。MP

我有一个代码可以计算一些导体的热传递。一个导体中发生的情况不会影响模型中的其他导体。因此，我试图使这些导体的解决方案并行运行，每个处理器采用一组不同的导体。现在，我认为代码可以在一个内核上运行，直到它到达这个循环，我在其中放置了命令：

MPI_INIT

MPI_FINALIZE

然后在我请求的多个内核上运行这段代码，然后在命令后返回到在一个内核上运行：

MPI_INIT

MPI_FINALIZE

遇到了。但我看到的是，输入文件由两个内核读取（如果我使用2个内核），所有输出也打印两次。MPI不像我想的那样工作吗？如果没有，那么我如何才能实现我想要的行为？我只希望代码在多个核心上运行，而不是在MPI_INIT和MPI_FINALIZE之外的任何其他子例程或部分代码中。

我不认为我完全理解这个问题，但首先要注意的是，MPI最多可以初始化一次。如此反复

MPI_Init
...
MPI_Finalize

这是不允许的。此外，

MPI_Init

和

MPI_Finalize

是昂贵的操作；你不想在循环中调用它们

MPI最初是围绕静态流程模型设计的，这意味着一组流程启动、工作和退出。听起来您希望在运行时更改进程数。这在MPI-2中是可能的（请参见

MPI\u Comm\u spawn

）

另一方面，持续启动和关闭过程会很慢。进程调用了

MPI\u Init

并不意味着它必须参与所有通信。以下是我将如何处理这个问题：

启动一个进程池。在程序开始时对所有进程调用

MPI_Init

，即使是那些只在本地工作的进程

在每个循环迭代中，为需要使用

MPI\u Comm\u create

进行通信的进程创建一个新的通信器，并将其用于所有通信，而不是

MPI\u Comm\u WORLD

在程序结束时，所有进程调用

MPI\u Finalize

我不认为我完全理解这个问题，但首先要注意的是MPI最多只能初始化一次。如此反复

MPI_Init
...
MPI_Finalize

这是不允许的。此外，

MPI_Init

和

MPI_Finalize

是昂贵的操作；你不想在循环中调用它们

MPI最初是围绕静态流程模型设计的，这意味着一组流程启动、工作和退出。听起来您希望在运行时更改进程数。这在MPI-2中是可能的（请参见

MPI\u Comm\u spawn

）

另一方面，持续启动和关闭过程会很慢。进程调用了

MPI\u Init

并不意味着它必须参与所有通信。以下是我将如何处理这个问题：

启动一个进程池。在程序开始时对所有进程调用

MPI_Init

，即使是那些只在本地工作的进程

在每个循环迭代中，为需要使用

MPI\u Comm\u create

进行通信的进程创建一个新的通信器，并将其用于所有通信，而不是

MPI\u Comm\u WORLD

在程序结束时，所有进程调用

MPI\u Finalize

这是一个常见的误解，尤其是在那些有类似OpenMP的经验的人当中，在OpenMP中，线程在程序中的不同点被分叉和连接

在MPI中，

MPI_Init

和

MPI_Finalize

初始化并完成MPI库；就这样。虽然标准有意对Init之前和Finalize之后发生的事情保持沉默，但实际上，

mpirun

或

mpiexec

命令通常会创建和启动进程。如果你打字

mpirun -np 4 hostname

例如，启动了四个进程，每个进程都运行

hostname

命令——这绝对不是MPI可执行文件，并且没有任何

MPI\u Init

或

MPI\u Finalize

调用。这些进程中的每一个都从开始到结束运行可执行文件，因此得到四个输出。启动进程的是mpirun（或mpiexec），而不是程序内部的任何MPI函数调用

那么，在您的程序中，整个程序将按照您的要求由尽可能多的进程运行。

这是一个常见的误解，尤其是在有类似OpenMP的经验的人中，在OpenMP中，线程在程序中的不同点分叉并连接