Networking 如何用周期、螺旋等边界条件可视化晶格？

我正在尝试编写一个特殊的六边形晶格生成器，它有几种边界条件，如螺旋BC、周期BC，我发现很难验证它是否正确工作。我试着用二维网络图（使用networkx）来绘制它们，正如我所预料的那样，结果是一团糟。现在我必须事先计算出邻接矩阵，并用计算出的邻接矩阵验证生成的网络。对于规则晶格来说，这很好，但是如果我在晶格上引入一些随机扰动，这种方法非常烦人。如果我能看到正确绘制的网络，那就容易多了

是否有可能正确显示具有各种边界条件的晶格？还是在其他软件工具中？有没有一种方便的方法来测试这种网络生成器

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谢谢。

假设你有每个点的3d坐标，一个相当简单的可视化工具是gnuplot。Gnuplot将为每个由换行符分隔的块绘制一条单独的线，因此

0  1  0
0  1  1

0  1  0
0  2  0

如果发出命令，将绘制两条线，从（0,1,0）到两点（0,1,1）和（0,2,0）

splot 'somefile' with lines

唯一的问题是，如果沿着某条直线有3个点，并且你画了一条线AC而不是AB和BC，它将不清晰

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但是，您可以通过拖动旋转3d绘图，这将有助于您的检查。

有趣的解决方案。但在这种情况下，必须计算出网络的三维坐标。例如，如果我们有一个具有周期性边界条件的正方形晶格，我们将必须计算网络中的节点如何在环面上展开。