Python 3.x 改进文件的快速检查方法

嗨，伙计们，我需要一个正确的代码来检查一个文件是否真的是有效的 快进一个文件

fasta:symmbol>到标头，后跟一个序列

> header1  
ADDFFGGVVSS

> header2  
GBHHYYTTRRR

有没有办法让这个愚蠢的函数更好

def is_header(line):
    """Checks if the line is a header line in fasta file."""
    return line[0] == '>'

def check_fasta(filename):
    """Checks if the file is a valid fasta file."""
    with open(filename, 'r') as fh:
        for line in fh:
            if not line.startswith(">") and sum(g for g,_ in groupby(fh, key=is_header)) == 0:
                return False
    return True

使用：

check_fasta('data/regions.txt')

结果:

False or True 

这不是一个好结果。可能是打印声明或返回错误

---

谢谢

现在你检查每一行；这将在没有“>”时立即引发错误-这是您想要的吗？另外，您要为检查的每一行重新打开文件？这不是问题的答案，但是--在您的

groupby

调用中，您要打开文件名。。。但您已经在with声明中打开了它。删除

groupby

调用中的

open（filename）

，并将其替换为

fh

@MrFuppes Hi实际上我想检查所有文件，因为snipet在找到第一个'>'时停止，假设它是一个fasta文件，但当我在空文件或部分fasta（有一些无'>'起始行）中使用它时，它返回True。我想检查一下intire文件。也许你可以利用现有的软件包，比如？它不在Python中，但您应该仍然能够从Python等脚本调用其可执行文件。编写自己的文件检查器可能会很痛苦；-）@PauloSergioSchlogl我对：和sum（g代表g，u在groupby（fh，key=is_header）中）感到困惑==0:有任何提示吗