Python 3.x 我怎样才能避免一个“错误”；分段故障（堆芯倾倒）“；使用PIL/OpenCV/Matplotlib加载大型.JP2图像时出错？

我在一个简短的脚本中运行以下简单的行，没有任何问题：

Python 3.5.2;
PIL 1.1.7;
OpenCV 2.4.9.1;
Matplotlib 3.0.1;

...
# for example:
img = plt.imread(i1)
...

但是，如果加载的.JP2的大小大于约500 MB，则Python3在尝试加载映像时会抛出以下错误：

“分段故障（堆芯转储）”

这不应该是RAM问题，因为当错误发生时，只有约40%的可用RAM被使用，当RAM被移除或添加到计算机时，错误保持不变。使用其他方式加载图像时，错误也保持不变，例如使用PIL

有没有办法避免这个错误或解决它？

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非常感谢

这不是一个真正的解决方案，更多的是一个可能有效或帮助其他人想出类似或进一步发展的想法

如果您想对每个monster JP2图像执行多个操作或裁剪，那么您可能需要提前付出代价，只需一次就可以将其转换为ImageMagick随后可以更轻松地处理的格式。因此，您的图像是20048x80000个2字节的短片，因此您可以将其扩展为16位PGM文件，如下所示：

convert monster.jp2 -depth 16 image.pgm

这大约需要3分钟。但是，如果您现在想从图像高度向下提取部分图像，现在可以从PGM中提取：

convert image.pgm -crop 400x400+0+6000 tile.tif

在18秒内，而不是从怪物JP2：

convert monster.jp2 -crop 400x400+0+6000 tile.tif

这需要153秒

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请注意，PGM将占用大量磁盘空间。。。。我想你也可以用TIFF做同样的尝试，它也可以保存16位数据，也可以进行LZW压缩。我想您也可以使用

libvips

更快地从PGM文件中提取磁贴。

这不是一个真正的解决方案，更多的是一个可以工作或帮助其他人想出类似或进一步开发的想法

如果您想对每个monster JP2图像执行多个操作或裁剪，那么您可能需要提前付出代价，只需一次就可以将其转换为ImageMagick随后可以更轻松地处理的格式。因此，您的图像是20048x80000个2字节的短片，因此您可以将其扩展为16位PGM文件，如下所示：

convert monster.jp2 -depth 16 image.pgm

这大约需要3分钟。但是，如果您现在想从图像高度向下提取部分图像，现在可以从PGM中提取：

convert image.pgm -crop 400x400+0+6000 tile.tif

在18秒内，而不是从怪物JP2：

convert monster.jp2 -crop 400x400+0+6000 tile.tif

这需要153秒

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请注意，PGM将占用大量磁盘空间。。。。我想你也可以用TIFF做同样的尝试，它也可以保存16位数据，也可以进行LZW压缩。我想您也可以使用

libvips

更快地从PGM文件中提取磁贴。

您的意思是JP2文件的磁盘容量超过500MB吗？或者它在加载时扩展到超过500MB的内存？您是如何创建JP2的，或者您可以提供一个指向其来源的链接吗？JP2文件的尺寸（以像素宽×像素高为单位）是多少？你在使用什么操作系统？你好，马克，是的，磁盘上的.jp2大于500 MB。我没有创建.JP2文件，这些是我下载的大图像（~20000像素宽，~60000像素高，I；16，JPEG2000）。例如，从这里：图像的宽度总是相等（或多或少），但长度会有所不同（决定磁盘上文件的大小）。我的操作系统是Ubuntu 16.04。谢谢您链接的图像是20k x 80k，即1.6千兆像素，每个2字节，因此内存至少为3.2GB。那么，所有的库和你的操作系统最好是64位？如果你提供更多关于你打算如何处理图像的信息，我可能会有一些建议，但是作为第一次尝试，我建议你考虑用<代码> vip替换<代码>分割错误< /代码>标签，因为这似乎是目前最有可能的解决方案。添加了“贵宾”标签！我通常会执行一些小操作，如平铺图像或从16位转换为8位。。。我可以用pyvips这样做吗？你是说JP2文件在磁盘上超过500MB？或者它在加载时扩展到超过500MB的内存？您是如何创建JP2的，或者您可以提供一个指向其来源的链接吗？JP2文件的尺寸（以像素宽×像素高为单位）是多少？你在使用什么操作系统？你好，马克，是的，磁盘上的.jp2大于500 MB。我没有创建.JP2文件，这些是我下载的大图像（~20000像素宽，~60000像素高，I；16，JPEG2000）。例如，从这里：图像的宽度总是相等（或多或少），但长度会有所不同（决定磁盘上文件的大小）。我的操作系统是Ubuntu 16.04。谢谢您链接的图像是20k x 80k，即1.6千兆像素，每个2字节，因此内存至少为3.2GB。那么，所有的库和你的操作系统最好是64位？如果你提供更多关于你打算如何处理图像的信息，我可能会有一些建议，但是作为第一次尝试，我建议你考虑用<代码> vip替换<代码>分割错误< /代码>标签，因为这似乎是目前最有可能的解决方案。添加了“贵宾”标签！我通常会执行一些小操作，如平铺图像或从16位转换为8位。。。我可以用pyvips做些类似的事情吗？我也正打算提出这个建议，呵呵。如果你写一个平铺TIFF，libvips可以很快读取它，例如

convert PSP\u 007219\u 1720\u RED.NOMAP.JP2-define TIFF:tile geometry=128x128-compress jpeg x.tif

在这台笔记本电脑上需要2500万，需要6.5gb的ram。@jcupitt John，从平铺TIFF中提取一个400x400+0+6000块的等价物是什么？另外，您的

-compress JPEG

是否继承/保留原始图像的10比特？谢谢。嘿，马克，你可以用

crop

。我希望10位不重要，但如果是，是的，我想你需要使用16位LZW@上面的cgohlke说枕头可以用jp2支持来制作（我不知道！），所以这也许是最好的方法。@jcupitt，好主意的家伙们，让我看看我能不能让它们在我的机器上工作！我也打算提出这个建议，呵呵。如果你写了一篇平铺的TIFF