Python 3.x 在Python的多个文件夹中组合多个图像

我有一个灰度图像文件夹（100x100像素），文件名如下：

• 文件_123_A.ome.tif
• 文件_123_B.ome.tif
• 文件_123_C.ome.tif
• 文件_125_A.ome.tif
• 文件_125_B.ome.tif
• 文件_125_C.ome.tif

每个文件名的编号（在我上面的示例中为123和125）链接图像，因此这些图像集是相关的

我正在尝试将文件读入一个numpy数组，然后将三个相关的图像组合成一个100x100x3或100x300的新图像

我可以愉快地将A集合中的图像读入一个数组，然后将B和C集合中的图像读入各自的数组。但是，一旦我这样做了，我就不能再检查文件名和图像的顺序是否相同，因此如果A数组中的图像0是B和C数组中正确的相关图像。我可以做到这一点，并已成功地让它工作，但我不确定这是最好的解决方案

由于每个图像的编号都是唯一的，因此我想编写一个解决方案，读取文件名并检查三个图像是否具有相同的唯一编号，是否为一组图像，例如a、B、C图像，然后将它们相应地组合在一起。如果有人能给我指出正确的方向，那将是非常棒的

不知道我解释得有多好，所以如果您需要澄清，请询问

谢谢

更新：

这段代码（见下文）在一个目录和子目录中为我获取一组唯一的文件名。它可能不是最有效的，但它确实有效。我现在正在努力解决的是，在实际图像文件上使用这个循环，进行比较，合并或连接具有每个唯一ID的三个图像

#Set directory to look in
file = glob.glob(r'my_directory\**\*.tif',recursive = True)

#Loop though the files and put all the uniques files name into a list
fname_lst = []
for img in file:
    i = img.split('\\')[5][:-12]
    fname_lst.append(i)
fname_lst = set(fname_lst)

---

显然.split对于我的文件名是唯一的，但它确实有效。

这应该可以满足您对当前目录中所有文件组的要求。我将让您添加错误处理和其他小变化：

#!/usr/bin/env python3

import cv2
from glob import glob

# Get list of files matching "*A.ome.tif"
files = glob("*A.ome.tif")

# Get list of unique stems
stems = [f.replace('A.ome.tif', '') for f in files]

# Iterate over unique stems
for stem in stems:
    A = cv2.imread(stem + 'A.ome.tif')
    B = cv2.imread(stem + 'B.ome.tif')
    C = cv2.imread(stem + 'C.ome.tif')
    # Stack images horizontally (side-by-side), use np.dstack() for merging channels
    result = np.hstack((A,B,C))
    cv2.imwrite(stem + 'result.tif', result)
    

---

这应该可以满足您对当前目录中所有文件组的要求。我将让您添加错误处理和其他小变化：

#!/usr/bin/env python3

import cv2
from glob import glob

# Get list of files matching "*A.ome.tif"
files = glob("*A.ome.tif")

# Get list of unique stems
stems = [f.replace('A.ome.tif', '') for f in files]

# Iterate over unique stems
for stem in stems:
    A = cv2.imread(stem + 'A.ome.tif')
    B = cv2.imread(stem + 'B.ome.tif')
    C = cv2.imread(stem + 'C.ome.tif')
    # Stack images horizontally (side-by-side), use np.dstack() for merging channels
    result = np.hstack((A,B,C))
    cv2.imwrite(stem + 'result.tif', result)
    

---

你的意思是说你的脚本应该在连接图像的整个目录中递归，或者它应该在一个目录中执行所有图像，或者你应该向它传递参数

file_XXX

，它应该只连接当前目录中以该前缀开头的图像？我想我是在问你想用什么参数调用脚本？谢谢你的回答。我需要找到文件夹中所有具有相同XXX的图像，并将这些图像的a、B、C版本连接在一起。对子目录执行此操作可能会变得复杂，因为每个子目录中的文件_XXX中的文件都会发生更改。这有意义吗？尝试使用

glob（）

获取所有TIFF的列表。然后删除每个文件名中第二个下划线后的所有内容，并将结果添加到一个集合中，这样您将拥有一组唯一的文件名前缀。然后你可以重复这些，添加

A/B/C

后缀并合并文件。我想我理解你的方法。我要试一试谢谢你的回复。试试看。单击问题下方的

edit

，然后粘贴任何你开始工作的代码，并说出你被卡住的地方。你的意思是你的脚本应该在连接图像的整个目录中递归，或者它应该在一个目录中处理所有图像，或者您应该向它传递参数

file_XXX

，并且它应该只连接当前目录中以该前缀开头的图像？我想我是在问你想用什么参数调用脚本？谢谢你的回答。我需要找到文件夹中所有具有相同XXX的图像，并将这些图像的a、B、C版本连接在一起。对子目录执行此操作可能会变得复杂，因为每个子目录中的文件_XXX中的文件都会发生更改。这有意义吗？尝试使用

glob（）

获取所有TIFF的列表。然后删除每个文件名中第二个下划线后的所有内容，并将结果添加到一个集合中，这样您将拥有一组唯一的文件名前缀。然后你可以重复这些，添加

A/B/C

后缀并合并文件。我想我理解你的方法。我要试一试谢谢你的回复。试试看。单击问题下方的

edit

，然后粘贴任何你开始工作的代码，并说出你被卡住的地方。这太棒了。非常感谢马克，只需对特定目录进行一点编辑，我就可以工作了。更好的是，我可以看看这个，看看它主要在做什么。有几点我需要检查和阅读。酷-祝你的项目好运。如果你被卡住了，回来问一个新问题-问题（和答案）是免费的：-）太棒了，非常感谢你，马克，对特定目录进行了一些编辑，我已经开始工作了。更好的是，我可以看看这个，看看它主要在做什么。有几点我需要检查和阅读。酷-祝你的项目好运。如果你陷入困境，回来问一个新问题-问题（和答案）是免费的：-）