在Fedora 17上安装python-igraph-0.6模块

我尝试了一段时间为我的EPD python安装python-igraph-0.6模块。 我构建了C-core，并按照各个站点上的说明进行操作：

/home/joseph/epd/bin/python setup.py build

或

/home/joseph/epd/bin/python setup.py安装

它总是产生相同的错误：

错误：命令“gcc”失败，退出状态为1

我必须做出可能的解释：要么“gcc”工作不正常（但我已经用./configure、make、make install编译了C-part），要么某个东西没有正确链接。 我已经看过类似的文章，安装了python-devel包等等。。。 但一切都没有改变

完整输出为：

[root@josephpython-igraph-0.6]#/home/joseph/epd/bin/python setup.py build
使用默认的include和库路径进行编译
如果编译失败，请编辑LIBIGRAPH_回退_*
setup.py中的变量，或在
setup.cfg指向正确的目录和库
安装IGRAPHE的C芯的位置
()
包含路径：/usr/Include/usr/local/Include
库路径：
运行构建
运行build\u py
运行build_ext
建筑“igraph.\u igraph”扩建
gcc-pthread-fno严格别名-g-O2-DNDEBUG-O2-fPIC-I/usr/include-I/usr/local/include-I.././build/include-I.././include-I/usr/local/include-I/home/joseph/epd/include/python2.7-c/common.c-o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/common.o
gcc-pthread-fno严格别名-g-O2-DNDEBUG-O2-fPIC-I/usr/include-I/usr/local/include-I.././build/include-I.././include-I/usr/local/include-I/home/joseph/epd/include/python2.7-c src/arpackobject.c-o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/arpackobject.o
在src/arpackobject.c中包含的文件中：23:0:
src/arpackobject.h:27:27:致命错误：igraph_arpack.h:没有这样的文件或目录
编译终止。
错误：命令“gcc”失败，退出状态为1

您收到的错误消息表明编译器找不到绑定到igraph的C核心所需的头。特别是，它缺少一个名为

igraph_arpack.h

的文件，但这不是唯一的一个，如果在这条消息之后继续编译，将会有更多的文件

igraph的Python接口的

setup.py

脚本依赖于

pkg config

来确定在哪里可以找到头，但在您的系统中，这失败了，可能是因为未安装

pkg config

本身。因此，我猜解决方案如下：

确保编译完C内核后运行

makeinstall

。你声称你这样做了，但为了完整起见，我想我还是要提一下

在系统上安装

pkg config

通过键入

pkg-config--cflags--libs-igraph检查
pkg-config
是否知道已安装的igraph的C核。如果您看到一堆编译器选项打印到标准输出，您就可以了

再次运行

python setup.py install

。这次它应该成功地调用

pkg config

，获得所需的编译器选项，并成功地编译Python接口

---

如果它仍然不工作（例如，因为您无法使

pkg config

工作），您可以打开

setup.cfg

并编辑

include_dirs

和

库_dirs

变量；前者应指向igraph include文件所在的文件夹（通常为

/usr/local/include/igraph

或

/usr/include/igraph

，具体取决于C内核的安装位置），后者应该指向

libigraph.so

所在的文件夹。

PS:“easy_install python igraph”会导致相同的错误消息。PS2:“yum install python igraph”会安装一些旧版本0.5.4-4，但是它不能在普通系统python或EPD python中导入。请包含

python setup.py build

的完整输出-您包含的行不是真正的信息。@Tamás以下是完整输出：@user1227298您应该用信息更新您的问题，而不是添加答案。是的，这是一个问题使用

pkg配置

。我必须更新指向igraph的路径：

export PKG\u CONFIG\u path=/home/…

。接下来，出现了

python-igraph-importorror:/igraph/\u-igraph.so:undefined-symbol:igraph\u warning\u handler\u ignore

错误，您已经在另一个博客上成功回答了该错误。谢谢！我希望您的软件包做得很好（必须比

NetworkX

快）。您可以使用这些信息更新igraph-Wiki。这将使noob用户免受一些挫折。感谢您提供软件和建议！！还有一条评论：我注意到

yum install igraph

安装了一个较旧的版本

igraph-5x

，该版本从在命令行中键入

igraph

开始（使用系统python）。@admins:我不明白这个问题或评论有什么问题。有一个问题已经解决了！这很有帮助。不要介意。