在python脚本内循环执行awk_Python_Linux_Csv_Awk

在python脚本内循环执行awk

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在python脚本内循环执行awk,python,linux,csv,awk,Python,Linux,Csv,Awk,我有一个15列的表格文件，我想在循环中为该文件的每一行执行2个awk命令（我正在python脚本中生成许多其他函数，因此这些awk命令应该在我的脚本中）简而言之：我要执行的每个命令都存储在两个变量中：strand_signature和strand_correction。所以我逐行读取我的csv文件并调用这两个脚本，但是在我的打印测试中，修改没有发生有人能解释一下我在哪一点上犯了错误吗？编写脚本最简单的方法是编写单独的行，甚至只是行的一部分，运行、测试，确保它工作正常，然后继续下一部分。这样，

我有一个15列的表格文件，我想在循环中为该文件的每一行执行2个awk命令（我正在python脚本中生成许多其他函数，因此这些awk命令应该在我的脚本中）

简而言之：我要执行的每个命令都存储在两个变量中：strand_signature和strand_correction。所以我逐行读取我的csv文件并调用这两个脚本，但是在我的打印测试中，修改没有发生

有人能解释一下我在哪一点上犯了错误吗？

编写脚本最简单的方法是编写单独的行，甚至只是行的一部分，运行、测试，确保它工作正常，然后继续下一部分。这样，您一次只能解决几个问题

相反，您选择了最困难的方法：编写整个脚本，然后尝试在之后修复所有问题。这意味着您必须同时考虑以下所有问题，因为每个问题都是一个完整的问题：

您的第一个awk命令在语法上无效，因为您试图在单引号中嵌套单引号，而不引用或转义它们

您的第二个awk命令在语法上无效，因为它缺少一个

awk命令都不输出任何内容

您可以指定

row

作为

awk

的文件名，即使这是Python列表而不是文件

您从未从

awk

即使您这样做了，

awk

是基于行的，而不是基于Python列表的，因此您必须相应地加入和拆分

最好的选择是扔掉所有的

awk

，改用Python。这样写和运行起来更容易、更健壮、更快：

with open('my_file.csv') as csv_file:
    csv_reader = csv.reader(csv_file, delimiter='\t')
    for row in csv_reader:
        if float(row[9]) > float(row[10]):
            row[15] = "-"
        else:
            row[15] = "+"
        # ...
        print(row)

编写脚本最简单的方法是编写单独的行，甚至只是行的一部分，运行、测试、确保它工作，然后继续下一部分。这样，您一次只能解决几个问题