在Google Colaboratory for Python上安装和导入MDAnalysis？问题

我正在尝试在Google Colaboratory上安装、导入和MDAnalysisTests库，我尝试了三种方法，但都无效：

使用默认值：！pip安装库

但我得到：

Collecting MDAnalysis
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/9e/19/1d32ded1891605facf6faf6e0de4ff6bd33db3f7983d84cfc10074363990/MDAnalysis-1.0.1.tar.gz
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

我读到这类错误与缺少补充库或其他相关，但我不知道在哪里可以找到更多信息，所以我希望，也许这个论坛中的某个人知道MDAnalysis是否需要一些特定的信息。我不知道什么是egg_info，搜索时我在代码中找到了一个文本为#egg=的示例，但我在上一次尝试中详细介绍了这个选项

使用默认值：！apt get-qq安装-y库

输出：

E: Unable to locate package MDAnalysis

Collecting git+https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git
  Cloning https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git to /tmp/pip-req-build-4e7svv83
  Running command git clone -q https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git /tmp/pip-req-build-4e7svv83
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

两者都不起作用

来自GitHub

在预览中，我发现我可以从GitHub导入库！令人惊叹的！（老实说，我一点也不懂语法），所以我找了一个，然后写了下一个代码：

!pip install git+https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git

输出：

E: Unable to locate package MDAnalysis

Collecting git+https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git
  Cloning https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git to /tmp/pip-req-build-4e7svv83
  Running command git clone -q https://github.com/MDAnalysis/mdanalysis.git /tmp/pip-req-build-4e7svv83
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

我发现了git+git:，git+ssh:的变体，但没有起作用

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这是在Colab上工作的MDAnalysis的一个特定问题吗？还是代码有问题？我甚至试着将“MDAnalysis”改为“MDAnalysis”。我在这个论坛上安装和预览问题，但是我没有结果。感谢阅读。

您可以使用conda在Colab中安装MDA（需要一段时间）

！wget-O mini.shhttps://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-4.6.14-Linux-x86_64.sh 
!bash./mini.sh-b-f-p/usr/local
!conda安装-q-y--prefix/usr/local-c conda forge mdanalysis
导入系统
sys.path.append（“/usr/local/lib/python3.7/site packages/”）

然后你可以导入它

将MDAnalysis导入为mda

您确定python安装正常吗？您可以安装其他pip软件包吗？您也可以尝试

pip3

如果在MDAnalysis需要python3Thanks来回答@Mitchell的情况下安装了多个python版本，我不知道

pip3

存在，现在我尝试了

！pip3安装MDAnalysis

，我得到了下一个输出：

正在下载收集MDAnalysishttps://files.pythonhosted.org/packages/9e/19/1d32ded1891605facf6faf6e0de4ff6bd33db3f7983d84cfc10074363990/MDAnalysis-1.0.1.tar.gz （3.8MB）|████████████████████████████████| 3.8MB 5.4MB/s错误：命令出错，退出状态为1:python setup.py egg_info检查日志以获得完整的命令输出。

相同的错误，但我不知道检查日志的位置，我修改了示例数据绑定器，但没有任何错误。这很奇怪，我尝试了

！pip2安装MDAnalysis

并开始安装，我认为colab现在不适用于python2，从1月份开始，我有一个错误

错误：fastai 0.7.0对chnow有要求我不能使用
导入MDAnalysis
我有一个错误：
ModuleNotFoundError:没有名为“MDAnalysis”的模块，但它已经安装。从源代码安装MDAnalysis需要一个运行正常的C/C++编译器和大量依赖项。虽然pip3安装“应该”起作用，但它取决于安装了完整的开发环境。你能用conda安装吗？如果您查看，则会看到conda安装的基本说明。最后，考虑在用户邮件列表中问你的问题——大多数MtDead开发者都会阅读它，并且更容易启动对话。绝对棒极了！成功了，科拉布在317年代安装了康达。之后，我安装了带有
的测试包！conda安装-c conda forge MDAnalysisTests
我运行了一些示例，它工作得非常好。谢谢你@kokarot！我想问更多的问题，
！conda install-q-y--prefix/usr/local
是一个常量行，可以用这个方法安装每个包吗？你只放了第一次，然后你就可以使用conda安装方法了？