Python 在pytest中运行Jupyter笔记本测试。奥瑟罗
我有一个python测试,它应该运行Jupyter笔记本文件并检查它是否有错误。 当我运行它时,它返回一个错误:Python 在pytest中运行Jupyter笔记本测试。奥瑟罗,python,jupyter-notebook,jupyter,pytest,Python,Jupyter Notebook,Jupyter,Pytest,我有一个python测试,它应该运行Jupyter笔记本文件并检查它是否有错误。 当我运行它时,它返回一个错误:OSError:[Errno 8]Exec格式错误:'./file.ipynb' 有人知道如何解决这个问题吗 我在类似问题中发现的似乎与我的情况不同 我的代码如下: import os import subprocess import tempfile import nbformat def _notebook_run(path): """Execute a notebo
OSError:[Errno 8]Exec格式错误:'./file.ipynb'
有人知道如何解决这个问题吗
我在类似问题中发现的似乎与我的情况不同
我的代码如下:
import os
import subprocess
import tempfile
import nbformat
def _notebook_run(path):
"""Execute a notebook via nbconvert and collect output.
:returns (parsed nb object, execution errors)
"""
dirname, __ = os.path.split(path)
os.chdir(dirname)
with tempfile.NamedTemporaryFile(suffix=".ipynb") as fout:
args = [path, fout.name, "nbconvert", "--to", "notebook", "--execute",
"--ExecutePreprocessor.timeout=60",
"--output"]
subprocess.check_call(args)
fout.seek(0)
nb = nbformat.read(fout, nbformat.current_nbformat)
errors = [output for cell in nb.cells if "outputs" in cell
for output in cell["outputs"]\
if output.output_type == "error"]
return nb, errors
def test_ipynb():
nb, errors = _notebook_run('./file.ipynb')
assert errors == []
您的
参数
错误。你所说的基本上是
$./file.ipynb tempfile.ipynb nbconvert--到笔记本电脑\
--execute--ExecuteProcessor.timeout=60--output
这不起作用,因为file.ipynb
不是可执行文件。您需要调用jupyter
:
$jupyter nbconvert./file.ipynb——输出tempfile.ipynb——到笔记本电脑\
--execute--ExecuteProcessor.timeout=60
翻译成Pythonargs
,例如:
import shutil
...
jupyter_exec = shutil.which('jupyter')
if jupyter_exec is not None:
args = [jupyter_exec, "nbconvert", path,
"--output", fout.name,
"--to", "notebook",
"--execute", "--ExecutePreprocessor.timeout=60"]
subprocess.check_call(args)
else:
# jupyter not installed or not found in PATH
非常感谢很高兴我能帮忙!难道你不知道如何通过这种方式运行jupyter笔记本获得输出吗?例如,当我运行notebook时,它给出的输出为1,但当我运行此代码时,它给出的文件包含大量信息,而不是运行notebook的结果。嗯,您能提供更多信息吗?您是指
子流程
返回的退出代码?如果使用subprocess.call
,它将返回退出代码,而subprocess.check\u call
将在退出代码为零时不返回任何内容,否则将引发异常。