如何在PyPy上使用Biopython？

我知道PyPy在Numpy和Biopython中的其他东西上有问题，但不是所有Biopython模块都使用这些东西。。。

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有人知道如何将模块Bio导入并使用到PyPy？

您应该能够像在常规Python版本中一样安装它。PyPy已经包含在Biopython的集成测试中

示例使用：

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如果您没有看到来自上述命令的任何错误消息，那么它应该可以正常工作。

您应该能够像在常规Python版本中一样安装它。PyPy已经包含在Biopython的集成测试中

示例使用：

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如果您没有看到来自上述命令的任何错误消息，那么它应该可以正常工作。

谢谢！！！我不了解虚拟的概念和工作。。。我没有安装mkvirtualenv[在尝试使用pip之后，也许…virtualenv-2.7是一样的吗？]但是你的回答给了我以下想法（和工作）：

$export PYTHONPATH=/usr/lib/pymodules/python2.7/$pypypypy.[…]>>import Bio>>

但是我认为将这条路径设置为.basrc可能是一个非常糟糕的主意，我是对的？这同样有效，而且我感觉比修改后的更好。bashrc

>>>>>>>导入sys>>>>>sys.path.append（'/usr/lib/pymodules/python2.7/'）>>>>>>>>导入Bio>>>>>>>

感谢虚拟现实版基本上为您提供了一个独立的Python环境，因此您可以与系统的Python并排安装各种Python版本。顺便说一下，你不必用它在PyPy上安装Biopython。这是在PyPy中使用Biopython的简单方法。没有virtualenv，只需使用

/usr/bin/pypy setup.py安装

或指向pypy可执行文件的任何路径即可。谢谢！！！我不了解虚拟的概念和工作。。。我没有安装mkvirtualenv[在尝试使用pip之后，也许…virtualenv-2.7是一样的吗？]但是你的回答给了我以下想法（和工作）：

$export PYTHONPATH=/usr/lib/pymodules/python2.7/$pypypypy.[…]>>import Bio>>

但是我认为将这条路径设置为.basrc可能是一个非常糟糕的主意，我是对的？这同样有效，而且我感觉比修改后的更好。bashrc

>>>>>>>导入sys>>>>>sys.path.append（'/usr/lib/pymodules/python2.7/'）>>>>>>>>导入Bio>>>>>>>

感谢虚拟现实版基本上为您提供了一个独立的Python环境，因此您可以与系统的Python并排安装各种Python版本。顺便说一下，你不必用它在PyPy上安装Biopython。这是在PyPy中使用Biopython的简单方法。没有virtualenv，只需使用

/usr/bin/pypy setup.py install

或指向pypy可执行文件的任何路径即可。

$ mkvirtualenv -p /usr/bin/pypy biopy
$ workon biopy
$ cd biopython  # or wherever your biopython directory is
$ python setup.py install
$ python -c 'import Bio'