如何在Python中读取16Uint图像

我有一个医学16未签名jpeg图像，我需要用python阅读它。 对于我的项目，这些图像只能用mathlab读取。我需要读取它的实际像素值，并且需要对这些值进行一些数学运算。 您可以在以下链接中找到该图像

当我被要求在mathlab中获取图像信息时，下面的描述就来了

i = imfinfo('di.jpg')

i = 

       Filename: [1x56 char]
    FileModDate: '14-Jul-2014 15:22:13'
       FileSize: 1044064
         Format: 'jpg'
  FormatVersion: ''
          Width: 1024
         Height: 1024
       BitDepth: 16
      ColorType: 'grayscale'
FormatSignature: ''
NumberOfSamples: 1
   CodingMethod: 'Huffman'
  CodingProcess: 'Lossless'
        Comment: {'Created by AccuSoft Corp.'}

我已经使用matplotlib、opencv、scikitImage、scipy、medpy、PIL库来阅读python中的图像。 我无法在这些类型中读取此图像

当我在python中使用时，会出现以下错误 代码： 导入图像 img=Image.open（'di.jpg'） 打印（img）

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请帮助解决我的问题

这似乎是

我看了一下你的照片。清楚的是，这是一幅16位灰度无损JPEG图像，采用哈夫曼编码。然而，对于无损编码，至少有：

• JPEG无损（罕见、旧）
• JPEG-LS（非常罕见，不太旧）
• JPEG2000（更新版）

有关这些方面的更多信息，请参阅：

cel

在其评论中提到的

GDCM

库使用

CharLS

库读取JPEG-LS。这个库确实有Python绑定，但不幸的是拒绝加载图像，因为它不是JPEG-LS文件。（但是，YMMV，请参见下面的malat评论。）

我还试图查询

ImageMagick

的

identify

，它提供了更多的信息：

identify.im6: Unsupported JPEG process: SOF type 0xc3 `/tmp/di.jpg' @ error/jpeg.c/JPEGErrorHandler/316.

现在，SOF类型在JPEG中很重要。错误消息表明该文件是“JPEG无损”文件。（这可能是因为它采用了哈夫曼编码。）令人讨厌的是，这类文件中使用的编码方案与标准JPEG完全不同，标准JPEG库不支持它

似乎至少有两个开源库支持文件格式：

• IJG的JPEG库版本6b（旧！）用特殊补丁补丁
• 托马斯·里希特的LibJPEG：

我尝试了后者，它的命令行工具确实识别了该文件并将其解码为更有用的文件（灰度PPM文件）

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因此，这至少提供了一条路线。您必须编译并安装该库，然后为其创建必要的Python绑定。或者，您可以将命令行工具用作外部转换工具，并与子流程一起运行，例如，

子流程

。最好的方法取决于您的平台。

为什么不使用matlab将其写入.mat文件并使用scipy读取此文件？我正在开发一个需要读写和计算值的项目，该项目将在基于服务器的环境中工作。因此，请向我推荐一种方法，而不是Mathlab我不熟悉这类数据，但也许你应该看看

GDCM

，看看你是否能用这个工具解决你的问题。它似乎有一个python包装，但我没有仔细看。谢谢你的重播。但是这些方法不适用于我的文件GDCM可以很好地读取图像。从命令行：

$gdcmimg di.jpg di.dcm

。完成。GDCM使用带有补丁的ijg库来处理16位无损编码。@malat:谢谢。我对我的答案进行了一些编辑，以确认它可能也适用于gdcm。

identify.im6: Unsupported JPEG process: SOF type 0xc3 `/tmp/di.jpg' @ error/jpeg.c/JPEGErrorHandler/316.