Python 如何修复这个程序中的TypeError（列表索引必须是整数，而不是str）？

在我正在使用的一个程序中，当我试图从

dict type

数据中挖掘/解析一个值时，我得到一个

TypeError

下面是该python程序的简要部分：

for c in results:
        print('value of c : ', c, type(c)) # what I added to see the issue with dict data
        for ci, lr in c['chain_info'].iteritems():
            outfile = open(lr.output_file, 'a')
            write = outfile.write

            if lr.number_vcf_lines > 0:
                write(CHAIN_STRING.format(CHAIN_STRING,
                            from_chr=c['chrom'], from_length=lr.chromosome_length,
                            from_start=0, from_end=lr.chromosome_length,
                            to_chr=c['chrom'], to_length=lr.end_length,
                            to_start=0, to_end=lr.sums[0] + lr.last_fragment_size + lr.sums[2], id=c['chrom']))
                write("\n")

完全回溯错误消息

错误类型：
错误值：列表索引必须是整数，而不是str
/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools/vcf2chain.py:456
回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/bin/g2gtools”，第4行，在
__导入\（'pkg \'u资源'）。运行\'u脚本（'g2gtools==0.1.31'，'g2gtools'）
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/setuptools-27.2.0-py2.7.egg/pkg_resources/______.py”，第744行，在运行脚本中
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/setuptools-27.2.0-py2.7.egg/pkg_resources/______.py”，第1499行，在运行脚本中
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools-0.1.31-py2.7.egg info/scripts/g2gtools”，第117行
G2GToolsApp（）
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools-0.1.31-py2.7.egg info/scripts/g2gtools”，第75行，在__
getattr（self，args.command）（）
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools-0.1.31-py2.7.egg info/scripts/g2gtools”，第90行，在vcf2链中
g2gtools.g2g_commands.command_vcf2chain（sys.argv[2:]，self.script_name+'vcf2chain'））
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools/g2g_commands.py”，第375行，在命令\u vcf2链中
vcf2chain（args.input、args.fasta、args.train、args.output、args.keep、args.passed、args.quality、args.diploid）
文件“/home/everestial007/anaconda3/envs/g2gtools/lib/python2.7/site packages/g2gtools/vcf2chain.py”，第493行，在vcf2chain中
引发G2G错误（“执行已暂停”）
g2gtools.exceptions.G2G错误：执行已暂停

文件的github位置：

看起来问题出在线路上：

from_chr=c['chrom'], from_length=lr.chromosome_length,

而且，Chain_字符串是作者创建的：

CHAIN_STRING = "chain 1000 {from_chr} {from_length} + {from_start} {from_end} " + "{to_chr} {to_length} + {to_start} {to_end} {id}"

我试着打印那个dict的值（通过添加一个print语句），看看问题出在哪里

print('value of c : ', c, type(c)) # gave me
('value of c : ', {'chrom': '1', 'stats': OrderedDict([('ACCEPTED', 0)]), 'chain_info': {'right': <g2gtools.vcf2chain.VCFtoChainInfo object at 0x7fe9de396dd0>, 'left': <g2gtools.vcf2chain.VCFtoChainInfo object at 0x7fe9d9252d50>}}, <type 'dict'>)

print（'c:'的值，c，type（c））#给了我
（'value of c:'，{'chrom'：'1'，'stats'：OrderedDict（[（'ACCEPTED'，0）]，'chain_info'：{'right'：，'left'：}，）

那么，这里的问题是什么？

---

这个数据/程序有什么问题？？？

在你的评论中，你说

c

是一个字符串，然后

from_chr=c['chrom']

不起作用，因为您不能为字符串指定作为字符串的索引

In [3]: c = 'my string'

In [4]: c['chrom']
---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-4-a201470ce4c5> in <module>()
----> 1 c['chrom']

TypeError: string indices must be integers

[3]中的

：c='my string'
在[4]中：c['chrom']
---------------------------------------------------------------------------
TypeError回溯（最近一次调用上次）
在（）
---->1 c[‘色度’]
TypeError:字符串索引必须是整数

---

您的错误消息说

列表索引必须是整数，而不是str

。我猜

c

就是一个列表。在这两种情况下，都不能给

c

一个字符串作为索引。

问题是，在for循环过程中，

变量c

作为列表返回：

for c in lr.chain_entries:
   write("\t".join(map(str, c)))
   write("\n") 

---

当读取另一行时，它将

c

作为列表返回。我不得不挖掘

c['chrom']

希望它是一个

dict类型

。但是，这个变量被forloop更改，导致了所有的麻烦。

完整的回溯会很有用。@glibdud：我以为人们会要求完整的回溯，但有时长问题不会引起注意。我只是放了完整的回溯。我建议在代码后面加上完整的回溯。在代码后面加上完整的回溯。什么是CHAIN_STRING。如果它是一个字符串，并且您正在使用它的

.format

方法，您是否有意将其自身传递回原始字符串？c是

dict type

在结果中c的起始循环

中，但在write语句中（在
If lr.number\u vcf\u lines>0:
之后）。这是怎么可能的。
c
在哪里更改了它的类型？我尝试了
try，除了TypeError
来测试它，在这个程序中似乎就是这样。这很奇怪，我也很惊讶。看起来像是c['chain_info']中的第二个嵌套for循环
，lr。iteritems（）
更改了
c
的值和类型。