Python 每一百万个特定字符的数量

首先，我使用的是Python

我试图找出染色体中每百万个字符中特定字符（碱基对）的数量

例如：

我希望a、g、t和c以及a、g、t和c在导入的文件中出现的次数

到目前为止，我可以使用“计数器”来计算整个文件中这些字符的数量，但我不知道如何将每一百万个字符分解一次

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提前谢谢

如果导入文件看起来像字符序列：

AGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTC

然后您可以应用此方法：

file = 'c:\\test\\chromosome.txt'

aCount = []
gCount = []
tCount = []
cCount = []
ACount = []
GCount = []
TCount = []
CCount = []

step = 1000000
start = 0
end = step

with open(file, 'r') as chromosome:
    data = chromosome.read()

while end < len(data):
  aCount.append(data.count('a', start, end))
  gCount.append(data.count('g', start, end))
  tCount.append(data.count('t', start, end))
  cCount.append(data.count('c', start, end))
  ACount.append(data.count('A', start, end))
  GCount.append(data.count('G', start, end))
  TCount.append(data.count('T', start, end))
  CCount.append(data.count('C', start, end))

  start = end
  end += step

file='c:\\test\\chromose.txt'
A账户=[]
gCount=[]
t计数=[]
帐户=[]
A账户=[]
GCount=[]
t计数=[]
帐户=[]
步长=1000000
开始=0
结束=步骤
将打开的（文件“r”）作为染色体：
数据=染色体。读取（）
而end

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最后你会得到8个列表。每个列表将包含每百万个特定字符的出现次数。

不完全确定您的要求。但是你不能简单地把结果除以一百万吗？或者。。。除以总数再乘以一百万。这是一个家庭作业问题吗？我不能将结果数除以一百万，因为这将给出平均数，而不是前一百万中的具体字符数。抱歉，如果有点模糊，我对编程有点陌生！