Python 拆分并连接文件中的列

我有一个以下格式的文件

score   div del ins  sequence  begin  end      (left)   repeat       class/family   begin  end    (left)  ID
   35    5.1  8.2  0.0  chrI           2     62 (230156) + (CA)n        Simple_repeat       1     66    (0)   1  
   14   16.5  5.7  7.2  chrI         231    300 (229918) + (TACCCA)n    Simple_repeat       1     69    (0)   2  
   17    0.0  0.0  0.0  chrI        6737   6755 (223463) + (A)n         Simple_repeat       1     19    (0)   3  
   14    4.3  4.2  0.0  chrI        9229   9252 (220966) + (TATT)n      Simple_repeat       1     25    (0)   4  
   11    3.8  6.5  6.5  chrI       12864  12894 (217324) + GA-rich      Low_complexity      1     31    (0)   5  
  691   25.7  4.5  4.5  chrI       22230  22539 (207679) + TY           LTR/Copia        5702   6011  (525)   6  
   26   14.1  1.7  3.5  chrI       23706  23712 (206506) + (ATAA)n      Simple_repeat       1     25   (33)   7  
   28   14.6  0.0  0.0  chrI       23713  23758 (206460) + (A)n         Simple_repeat       1     46    (0)   8  
   26   14.1  1.7  3.5  chrI       23759  23764 (206454) + (ATAA)n      Simple_repeat      26     58    (0)   7  
   12   11.2  3.2  3.2  chrI       25029  25059 (205159) + GA-rich      Low_complexity      1     31    (0)   9  
   12   10.1  9.4  0.0  chrI       30986  31017 (199201) + (TTGTT)n     Simple_repeat       1     35    (0)  10  
   30    3.5  0.0  0.0  chrI       31117  31146 (199072) + (AT)n        Simple_repeat       1     30    (0)  11  
   20    0.0  0.0  0.0  chrI       31484  31505 (198713) + (CA)n        Simple_repeat       1     22    (0)  12  
   15    0.0  0.0  0.0  chrI       31505  31521 (198697) + (AT)n        Simple_repeat       1     17    (0)  13 *
   13   24.7  0.0  0.0  chrI       33392  33426 (196792) + (AAC)n       Simple_repeat       1     35    (0)  14  
   16   15.9  0.0  0.0  chrI       35114  35141 (195077) + A-rich       Low_complexity      1     28    (0)  15  
   18   19.9  0.0  0.0  chrI       36419  36453 (193765) + (T)n         Simple_repeat       1     35    (0)  16  
   13   24.2  0.0  5.9  chrI       42749  42802 (187416) + A-rich       Low_complexity      1     51    (0)  17  
   16    5.3  0.0  0.0  chrI       45631  45650 (184568) + (T)n         Simple_repeat       1     20    (0)  18     

我希望有一个输出，其中只有

chr:begin-end

我使用的代码如下

import sys
for line in open(sys.argv[1],'r'):
  columns = line.strip().split('\s')
  print columns[5]+":"+ columns[6]+"-"+columns[7]

然而，我得到了一个错误

Traceback (most recent call last):
  File "columnstrip.py", line 4, in <module>
    print columns[5]+":"+ columns[6]+"-"+columns[7]
IndexError: list index out of range

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“columnstrip.py”，第4行，在
打印列[5]+“：“+列[6]+”-“+列[7]
索引器：列表索引超出范围

我哪里做错了？我将非常感谢您在这方面的帮助。

尝试：

print len(line.strip().split('\s'))

您将得到1，因此当您尝试访问

列[6]

和

列[7]

时，您会得到该异常

改用不带任何参数的方式：

例如，

'1 2 3'.split（）

返回

['1'，'2'，'3']

---

在文件中，它似乎不是一个空格。正如@marounnaroun所说，如果您

打印列

，您将看到整行是一项。只需使用

.split（）

就可以了。这里有一个指向此文件的链接，供您参考。嗨，Maroun，这似乎有效。但是你能不能给我最后的命令来处理我的文件。这样我就有了一个输出chr:begin-end@Dash我会把它留给你，你自己试试看，如果你有问题，我们会帮助你的。我是一个完全的新手。但正如您所说，我将尝试line.strip（序列、开始、结束）。split（）请在此处更正我，您实际上不需要

strip

。我得到一个空文件。我知道我把事情搞砸了。为打开的行导入系统（sys.argv[1]，'r'）：'sequence begin end'.split（）