Python 将距离矩阵转换为newick字符串格式的系统发育树

我通过读取一个FASTA文件创建了一个距离矩阵，现在我被要求编写一个函数，该函数将以newick字符串格式生成一个系统发育树。函数将取一个参数作为距离矩阵。你能帮我从一些代码开始吗

格式示例：

印刷品（upgma（爱德华兹））

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（E:17.00，（（（F:0.50，B:0.50）：5.75，G:6.25）：2.00，（D:4.00，A:4.00）：4.25）：6.25，C:14.50）：2.50）

BioPython的

Seq

类型没有

iter\u kmer

方法。也许您正在从

skbio

中寻找等效的类

获取红色的树（）。获取红色高棉（）。对不起，只是个坏笑话