Python 拆分、合并、排序CSV

Python 拆分、合并、排序CSV,python,python-2.7,Python,Python 2.7,我有几个CSV文件,其中包含来自几个传感器的测量值 s1.CSV: date;hour;source;values 01/25/12;10:20:00;a; 88 -84 27 01/25/12;10:30:00;a; -80 01/25/12;10:50:00;b; -96 3 -88 01/25/12;09:00:00;b; -97 101 01/25/12;09:10:00;c; 28 s2.CSV: date;hour;source;values 01/25/12;10:20:00;a

我有几个CSV文件,其中包含来自几个传感器的测量值

s1.CSV:

date;hour;source;values
01/25/12;10:20:00;a; 88 -84 27
01/25/12;10:30:00;a; -80
01/25/12;10:50:00;b; -96 3 -88
01/25/12;09:00:00;b; -97 101
01/25/12;09:10:00;c; 28
s2.CSV:

date;hour;source;values
01/25/12;10:20:00;a; 133
01/25/12;10:25:00;a; -8 -5
我想按来源(a/b/c)创建一个CSV,每个度量值在单独的列中,按日期和小时排序

a、 CSV:

date;hour;source;s1;s2
01/25/12;10:20:00;a; 88 -84 27; 133
01/25/12;10:25:00;a; ; -8 -5
01/25/12;10:30:00;a; -80;

我被困在这里:

import glob
import csv
import os
os.system('cls')

sources = dict()
sensor = 0

filelist = glob.glob("*.csv")

for f in filelist:
    reader = csv.DictReader(open(f),delimiter=";")
    for row in reader:
#       date = row['date'] # date later
        hour = row['hour']
        val = row['values']
        source = row['source']

        if not sources.has_key(source): # new source
            sources[source] = list()
#       
        sources[source].append({'hour':hour, 'sensor'+`sensor`:val})

    sensor+=1

我不确定数据结构是否适合排序。我也喜欢重复列名

根据你提供的数据,我用熊猫做了一些东西。请参阅下面的代码

由于
hour
source
在一列中重复,因此输出是不理想的。当我也在学习的时候,我也欢迎任何关于熊猫是否能达到OP要求的专家意见

In [1]: import pandas as pd

In [2]: s1 = pd.read_csv('s1.csv', delimiter=';', parse_dates=True)

In [3]: s1
Out[3]: 
       date      hour source      values
0  01/25/12  10:20:00      a   88 -84 27
1  01/25/12  10:30:00      a         -80
2  01/25/12  10:50:00      b   -96 3 -88
3  01/25/12  09:00:00      b     -97 101
4  01/25/12  09:10:00      c          28

In [4]: s2 = pd.read_csv('s2.csv', delimiter=';', parse_dates=True)

In [5]: s2
Out[5]: 
       date      hour source  values
0  01/25/12  10:20:00      a     133
1  01/25/12  10:25:00      a   -8 -5

In [6]: joined = s1.append(s2)

In [7]: joined
Out[7]: 
       date      hour source      values
0  01/25/12  10:20:00      a   88 -84 27
1  01/25/12  10:30:00      a         -80
2  01/25/12  10:50:00      b   -96 3 -88
3  01/25/12  09:00:00      b     -97 101
4  01/25/12  09:10:00      c          28
0  01/25/12  10:20:00      a         133
1  01/25/12  10:25:00      a       -8 -5

In [8]: grouped = joined.groupby('hour').sum() 

In [9]: grouped.to_csv('a.csv')

In [10]: grouped
Out[10]: 
                      date source          values
hour                                             
09:00:00          01/25/12      b         -97 101
09:10:00          01/25/12      c              28
10:20:00  01/25/1201/25/12     aa   88 -84 27 133
10:25:00          01/25/12      a           -8 -5
10:30:00          01/25/12      a             -80
10:50:00          01/25/12      b       -96 3 -88

根据你提供的数据,我用熊猫做了一些东西。请参阅下面的代码

由于
hour
source
在一列中重复,因此输出是不理想的。当我也在学习的时候,我也欢迎任何关于熊猫是否能达到OP要求的专家意见

In [1]: import pandas as pd

In [2]: s1 = pd.read_csv('s1.csv', delimiter=';', parse_dates=True)

In [3]: s1
Out[3]: 
       date      hour source      values
0  01/25/12  10:20:00      a   88 -84 27
1  01/25/12  10:30:00      a         -80
2  01/25/12  10:50:00      b   -96 3 -88
3  01/25/12  09:00:00      b     -97 101
4  01/25/12  09:10:00      c          28

In [4]: s2 = pd.read_csv('s2.csv', delimiter=';', parse_dates=True)

In [5]: s2
Out[5]: 
       date      hour source  values
0  01/25/12  10:20:00      a     133
1  01/25/12  10:25:00      a   -8 -5

In [6]: joined = s1.append(s2)

In [7]: joined
Out[7]: 
       date      hour source      values
0  01/25/12  10:20:00      a   88 -84 27
1  01/25/12  10:30:00      a         -80
2  01/25/12  10:50:00      b   -96 3 -88
3  01/25/12  09:00:00      b     -97 101
4  01/25/12  09:10:00      c          28
0  01/25/12  10:20:00      a         133
1  01/25/12  10:25:00      a       -8 -5

In [8]: grouped = joined.groupby('hour').sum() 

In [9]: grouped.to_csv('a.csv')

In [10]: grouped
Out[10]: 
                      date source          values
hour                                             
09:00:00          01/25/12      b         -97 101
09:10:00          01/25/12      c              28
10:20:00  01/25/1201/25/12     aa   88 -84 27 133
10:25:00          01/25/12      a           -8 -5
10:30:00          01/25/12      a             -80
10:50:00          01/25/12      b       -96 3 -88

如果我理解正确,您有多个文件,每个文件对应一个给定的“传感器”,文件名中有传感器的标识。您希望读取文件,然后再次将其写入单独的文件中,这次按“源”划分,将来自不同传感器的数据合并成最后几行

以下是我认为你想要做的:

  • 读取中的数据,并构建嵌套字典数据结构,如下所示:
  • 顶级键将是源(例如
    'a'
  • 第二级将由
    (日期、时间)
    元组键入
  • 最里面的级别将由传感器键入,取自文件名,并将实际传感器读数作为值
  • 您还需要跟踪已看到的所有传感器
  • 要写出数据,您需要循环最外层字典的项,为每个项创建一个新的输出文件
  • 每个文件的行将通过对下一个字典的键进行排序来确定
  • 每行的最后一个值将通过连接最内层dict的值来形成,并为任何缺少的值填充一个空字符串
  • 下面是一些代码:

    from collections import defaultdict
    from datetime import datetime
    import csv
    import glob
    import os
    
    # data structure is data[source][date, time][sensor] = value, with "" as default value
    data = defaultdict(lambda: defaultdict(lambda: defaultdict(str)))
    sensors = []
    
    filelist = glob.glob("*.csv")
    
    # read old files
    for fn in filelist:
        sensor = os.path.splitext(fn)[0]
        sensors.append(sensor)
        with open(fn, 'rb') as f:
            reader = csv.DictReader(f, delimiter=";")
            for row in reader:
                date = datetime.strptime(row['date'], '%m/%d/%y')
                data[row['source']][date, row['hour']][sensor] = row['values']
    
    sensors.sort() # note, this may not give the best sort order
    header = ['date', 'hour', 'source'] + sensors
    
    for source, source_data in data.iteritems():
        fn = "{}.csv".format(source)
        with open(fn, 'wb') as f:
            writer = csv.writer(f, delimiter=";")
            writer.writerow(header)
            for (date, time), hour_data in sorted(source_data.items()):
                values = [hour_data[sensor] for sensor in sensors]
                writer.writerow([date.strftime('%m/%d/%y'), time, source] + values)
    
    我只将日期字段转换为内部类型,因为否则基于日期的排序将无法正常工作(2013年1月的日期将出现在2012年2月的日期之前)。在未来,考虑使用ISO 8601风格的日期格式,<代码> YYY-MM-DD ,它可以被安全地排序为字符串。其余的值仅作为字符串处理,没有解释

    代码假定传感器的值可以按字典顺序排列。如果您只有其中的几个,例如
    s1
    s2
    ,则可能出现这种情况。但是,如果您有一个
    s10
    ,它将被排序在
    s2
    之前。要解决这个问题,你需要一个“自然”排序,这比我在这里能解决的更复杂(但更多信息请参阅)


    最后一个警告:如果您在同一个文件夹中多次运行此解决方案,则可能会产生不良后果。这是因为当您再次运行时,
    glob.glob('*.csv')
    会将输出文件(例如
    a.csv
    )视为输入文件。

    如果我理解正确,您有多个文件,每个文件对应于给定的“传感器”,文件名中有传感器的标识。您希望读取文件,然后再次将其写入单独的文件中,这次按“源”划分,将来自不同传感器的数据合并成最后几行

    以下是我认为你想要做的:

  • 读取中的数据,并构建嵌套字典数据结构,如下所示:
  • 顶级键将是源(例如
    'a'
  • 第二级将由
    (日期、时间)
    元组键入
  • 最里面的级别将由传感器键入,取自文件名,并将实际传感器读数作为值
  • 您还需要跟踪已看到的所有传感器
  • 要写出数据,您需要循环最外层字典的项,为每个项创建一个新的输出文件
  • 每个文件的行将通过对下一个字典的键进行排序来确定
  • 每行的最后一个值将通过连接最内层dict的值来形成,并为任何缺少的值填充一个空字符串
  • 下面是一些代码:

    from collections import defaultdict
    from datetime import datetime
    import csv
    import glob
    import os
    
    # data structure is data[source][date, time][sensor] = value, with "" as default value
    data = defaultdict(lambda: defaultdict(lambda: defaultdict(str)))
    sensors = []
    
    filelist = glob.glob("*.csv")
    
    # read old files
    for fn in filelist:
        sensor = os.path.splitext(fn)[0]
        sensors.append(sensor)
        with open(fn, 'rb') as f:
            reader = csv.DictReader(f, delimiter=";")
            for row in reader:
                date = datetime.strptime(row['date'], '%m/%d/%y')
                data[row['source']][date, row['hour']][sensor] = row['values']
    
    sensors.sort() # note, this may not give the best sort order
    header = ['date', 'hour', 'source'] + sensors
    
    for source, source_data in data.iteritems():
        fn = "{}.csv".format(source)
        with open(fn, 'wb') as f:
            writer = csv.writer(f, delimiter=";")
            writer.writerow(header)
            for (date, time), hour_data in sorted(source_data.items()):
                values = [hour_data[sensor] for sensor in sensors]
                writer.writerow([date.strftime('%m/%d/%y'), time, source] + values)
    
    我只将日期字段转换为内部类型,因为否则基于日期的排序将无法正常工作(2013年1月的日期将出现在2012年2月的日期之前)。在未来,考虑使用ISO 8601风格的日期格式,<代码> YYY-MM-DD ,它可以被安全地排序为字符串。其余的值仅作为字符串处理,没有解释

    代码假定传感器的值可以按字典顺序排列。如果您只有其中的几个,例如
    s1
    s2
    ,则可能出现这种情况。但是,如果您有一个
    s10
    ,它将被排序在
    s2
    之前。要解决这个问题,你需要一个“自然”排序,这比我在这里能解决的更复杂(但更多信息请参阅)


    最后一个警告:如果您在同一个文件夹中多次运行此解决方案,则可能会产生不良后果。这是因为当您再次运行时,
    glob.glob('*.csv')
    会将输出文件(例如
    a.csv
    )视为输入文件。

    请不要吝惜您的第一次尝试!你想学习,对吗?让我们帮助您改进您自己的努力。更重要的是,如果您不向我们展示您的尝试,这个问题将不得不结束,因为您不会“展示对正在解决的问题的最低理解”。是的,请发布您的想法,因为这更像是编辑的动机,而不是从头开始创建。除非你只是想要伪代码(“创建一个以时间为键的字典…”),否则我建议使用Pandas Package