在drmaa python中将作业数组索引作为参数传递
我正在使用lsf drmaa实现,并通过drmaa python进行接口。我通常将环境变量$LSB_JOBINDEX作为参数传入run.sh脚本。通过drmaa-python,我创建了在drmaa python中将作业数组索引作为参数传递,python,lsf,drmaa,Python,Lsf,Drmaa,我正在使用lsf drmaa实现,并通过drmaa python进行接口。我通常将环境变量$LSB_JOBINDEX作为参数传入run.sh脚本。通过drmaa-python,我创建了JobTemplate-jt,并希望将其作为参数传递。我已尝试使用参数索引,但此命令对我无效:jt.args=[str(drmaa.JobTemplate.PARAMETRIC\u INDEX)] 我收到以下错误: W #29c0 [ 1227.22] * '$drmaa_incr_ph$' can not b
JobTemplate-jt
,并希望将其作为参数传递。我已尝试使用参数索引,但此命令对我无效:jt.args=[str(drmaa.JobTemplate.PARAMETRIC\u INDEX)]
我收到以下错误:
W #29c0 [ 1227.22] * '$drmaa_incr_ph$' can not be expanded in '$drmaa_incr_ph$'; removing from string
我哪里出了问题,和/或如何使用其他方法传递索引?谢谢--您应该能够(在运行脚本中)通过环境变量
$SGE\u TASK\u ID
引用参数化索引的值。qmaster负责在脚本提交相应作业时,使用脚本中的每个数组索引值扩展/填充$SGE\u TASK\u ID