Python索引器错误：在vcf中查找SNP时列表索引超出范围

大家好，我应该使用Python脚本从vcf文件中的csv文件中识别指定位置的可能SNP。
我刚开始使用python，遗憾的是，我总是遇到以下错误：

 Traceback (most recent call last):
 File "getSNPs.py", line 20, in <module>    oo = line[2] + "_" +
 line[3]
 IndexError: list index out of range from the following script
 !/bin/python usage: python getSNPs.py your.vcf PhenoSNPs.csv

---

例如，如果

i='aa'

并且您执行

line=i.split（“，”

这意味着

line=['aa']

，那么当您执行

line[2]+“\u”+line[3]

时，您将得到一个

索引器，因为
line
没有第二和第三个元素

使用
try/except
或重新思考代码的逻辑

import sys
import gzip

SNPs = {}

for i in gzip.open(sys.argv[1], "r"):
    if '#' not in i:
        line = i.split("\t")
        oo = line[0] + "_" + line[1]
        SNPs[oo] = i

pp = sys.argv[1] + ".captureSNPs"

out = open(pp, "w")

for i in open(sys.argv[2], "r"):
    line = i.split(",")
    oo = line[2] + "_" + line[3]
    try:
        out.write(SNPs[oo])
    except KeyError:
        ow = line[2] + "\t" + line[3] + "\t" + "not covered" + "\n"
        out.write(ow)