使用Networkx（Python）进行图形遍历

我正在使用Networkx来管理依赖关系图。 假设我有一个图表，每个字母代表一个服务器

>>> G = nx.Graph()
>>> G.add_edge("A","B")
>>> G.add_edge("A","H")
>>> G.add_edge("H","C")
>>> G.add_edge("B","C")
>>> G.add_edge("B","D")

           A
         /   \
       H       B
     /        /  \
   C         C     D 

在这里我们可以看到，在开始A之前，我们需要开始H和B，开始H，我们需要开始C，然后开始B，我们需要开始C和D

通过稍微摆弄一下Networkx，我发现我可以通过进行dfs遍历来实现这一点

print nx.dfs_successors(G,"A")
{A:[H,B], H:[C], B:[D] }

但我对这种方法有一个问题。正如您所看到的，当树中有两个相同的字母时，Networkx只选择将其中一个放入最终结构中（这是正确的），但我需要完整的结构 如何强制Networkx添加到结构B:[D，C]

我想通过这样做来精确说明这一点

>>> nx.dfs_successors(G,"B")
{'B': ['C', 'D']}

所以一切都是“内部”正确的，只是dfs_的继任者没有以我希望的方式显示它

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谢谢你

接受了你的代码，你的图表并没有像你期望的那样出来。如果您这样做：

import pylab as p
import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_edge("A","B")
G.add_edge("A","H")
G.add_edge("H","C")
G.add_edge("B","C")
G.add_edge("B","D")

nx.draw(G)
p.show()

您将看到以下图形：

这是由于

G的逻辑造成的。添加边缘（“A”、“B”）

：

如果

G

没有id为“A”的节点，则添加它

如果

G

没有id为“B”的节点，则添加它

用新边将“A”连接到“B”

因此，您只创建了五个节点，而不是图片中的六个节点

编辑 Networkx可以将任何哈希值作为节点的值，在图形中它使用str（节点）标记每个圆。因此，我们可以简单地定义自己的节点类（您可能想将其称为服务器？），并为其提供所需的行为

import pylab as p
import networkx as nx


class Node(object):
    nodes = []

    def __init__(self, label):
        self._label = label

    def __str__(self):
        return self._label

nodes = [Node(l) for l in ["A","B","C","C","D","H"]]
edges = [(0,1),(0,5),(5,2),(1,3),(1,4)]

G = nx.Graph()
for i,j in edges:
    G.add_edge(nodes[i], nodes[j])

nx.draw(G)
p.show()

给我们

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这就是你想要的。

我想你想要的是拓扑排序

这仅在具有DAG（有向无环图）时有效。 如果是这样，您也可以绘制所需的树-如下所示：

import uuid
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.DiGraph()
G.add_edge("A","B")
G.add_edge("A","H")
G.add_edge("H","C")
G.add_edge("B","C")
G.add_edge("B","D")

order =  nx.topological_sort(G)
print "topological sort"
print order

# build tree
start = order[0]
nodes = [order[0]] # start with first node in topological order
labels = {}
print "edges"
tree = nx.Graph()
while nodes:
    source = nodes.pop()
    labels[source] = source
    for target in G.neighbors(source):
        if target in tree:
            t = uuid.uuid1() # new unique id
        else:
            t = target
        labels[t] = target
        tree.add_edge(source,t)
        print source,target,source,t
        nodes.append(target)

nx.draw(tree,labels=labels)
plt.show()

图形使用标签映射将节点的ID映射到原始标签

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感谢您绘制图表。这就是我“认为”Networkx在我背后所做的。因此，我的问题是：如何使用Networkx创建我的示例中的树？典型的理想情况是，当我创建G.add_边（“B”，“C”）时，创建一个新节点“C”是为了重用连接到H的on。然后，您需要将该新节点称为其他节点。可能是C1和C2。据我所知，NetworkX不允许多个节点具有相同的标签。但我需要节点具有相同的标签。就像我在主线中说的。我的节点是servername，我不能更改名称，否则我不知道哪个是哪个。。。但实际上，托尔斯滕·克兰兹不是“错”的，而是正确的，B取决于“C和D”。只是算法“dfs_successivers（）”的输出B只依赖于D，如果我的树不能用于Networkx，那么这是错误的，是否可以用于其他库？感谢第二个例子，希望这符合你的需要。