Python Networkx未按属性正确着色边
我试图在networkx中描述一个传输网络,到目前为止我一直做得很好,但问题如下: 我从txt文件中加载了edgelist,格式如下:Python Networkx未按属性正确着色边,python,dataframe,graph,networkx,graph-coloring,Python,Dataframe,Graph,Networkx,Graph Coloring,我试图在networkx中描述一个传输网络,到目前为止我一直做得很好,但问题如下: 我从txt文件中加载了edgelist,格式如下: 61 1 54 79 66 134 68 57 1 478947.434 4204495.502 2 478909.145 4204244.629 3 479065.936 4204709.003 4 478880.827 4204297.676 5 478993.409 4204167.957 等等。此外,为了在正确的
61 1
54 79
66 134
68 57
1 478947.434 4204495.502
2 478909.145 4204244.629
3 479065.936 4204709.003
4 478880.827 4204297.676
5 478993.409 4204167.957
等等。此外,为了在正确的位置绘制网络节点,我加载了一个带有节点坐标的txt,并将其添加到图形中,其格式如下:
61 1
54 79
66 134
68 57
1 478947.434 4204495.502
2 478909.145 4204244.629
3 479065.936 4204709.003
4 478880.827 4204297.676
5 478993.409 4204167.957
之后,我运行下面的脚本,正确地描述了我的网络位置
import networkx as nx
import numpy as py
import copy
import matplotlib.pyplot as plt
import xlwings as xw
from xlwings import Book, Range
pos={}
with open(r'C:\Users\alexl\Documents\new_python\nodes_coordinates.txt') as f:
for line in f:
node, x, y = line.split()
pos[node] = float(x), float(y)
print(pos)
network0 = nx.read_edgelist(r'C:\Users\alexl\Documents\new_python\init_edgelist.txt', create_using = nx.OrderedDiGraph)
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = G, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle = 'arc3,rad=0.1')
plt.show()
现在,我想要的是正确地为每条边指定“权重”,并根据此属性为其着色。每个边都有3种可能的结果,0、1和2,所以我想要3种不同的颜色,例如,红色表示0,绿色表示1,蓝色表示2。我有一本Python字典,如下所示:
{0: 1.0, 1: 1.0, 2: 0.0, 3: 1.0, 4: 1.0, 5: 0.0, 6: 0.0, 7: 0.0, 8: 1.0,...
等等。第一个值(1.0)对应于上面edgelist的第一条边,第二个值(1.0)对应于第二条边,等等。但是我发现networkx不理解这一点,并且没有正确地为我的网络着色。我将dictionary转换为list并执行了以下操作:
var1 = G.values()
list1 = list(var1)
col = []
for n in range(len(list1)):
if list1[n] == 0:
col.append('b')
elif list1[n] == 1:
#col.append('r')
else:
#col.append('g')
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = col, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle = 'arc3,rad=0.1')
我检查了结果,但信件不正确。我认为,如果列表中有32个'0',它将使用我指定给它的颜色为32条边着色,但不是正确的边。(但每次我运行它时,相同的32条边都是这样着色的,所以它可能不是随机的。)我想知道什么是错误的。我也试着把它当作一本字典(不是转换成列表),但实际上颜色不止3种,我不知道;我不知道为什么。
我是否应该尝试将这些值(0、1、1、2等)添加到edgelist.txt中,以便正确完成赋值?传递给绘图函数的边的顺序很重要。
您需要确保您的
edge\u color
列表(col
)与network0.edges
)的顺序相同,而不是这样
之所以发生这种情况,是因为network0.edges
与您的init_edgelist.txt
文件的顺序不同,这可能是您假设的
要检查此项,请尝试打印network0.edges
并进行比较
解决方案
相反,我建议在创建network0
时向边缘添加带有假装颜色的边缘权重,如下所示:
G = {0: 1.0, 1: 1.0, 2: 0.0, 3: 1.0, 4: 1.0, 5: 0.0, 6: 0.0, 7: 0.0, 8: 1.0}
list1 = list(G.values())
col = []
for n in range(len(list1)):
if list1[n] == 0:
col.append('b')
elif list1[n] == 1:
col.append('r')
else:
col.append('g')
network0 = nx.OrderedDiGraph()
i = 0
with open(r'init_edgelist.txt') as f:
for line in f:
n1, n2 = line.split()
network0.add_edge(n1, n2, color = col[i])
i += 1
然后,您只需提取颜色并绘制:
colors = [network0[u][v]['color'] for u,v in network0.edges()]
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = colors, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle='arc3,rad=0.1')
完整代码:
变量是什么?
G
?G是这样一个字典:{0:1.0,1:1.0,2:0.0,3:1.0,4:1.0,5:0.0,6:0.0,7:0.0,8:1.0,
。我想要的是在边中一对一地分配字典值。边列表中的字典“项”和边一样多,我想要第一个值(1.0)在着色时指定给edgelist的第一条边。同时,根据字典值(0.0、1.0或2.0)进行着色。检查最后一次编辑,另一个在代码中有一个小错误。首先,非常感谢您尝试解决我的问题。我编写了最后一个脚本,但没有正确返回边,不幸的是…initial_edgelist.txt的前5行是:61 1 54 79 66 134 68 57 65
。当我打印network0.edgest时,我看到他的:('61','1'),('61','69'),('61','60'),('1','128'),('1','75'))
。我知道这种表示法可能会更好,因为它首先有以61开头的所有边,然后所有边都以1开头,等等。但我不想要这个。我真的很感激你回答了我的问题!我对networkx很陌生。但是你检查过边是否有你假装的颜色吗?我的意思是,这个答案不是故意的o回答你的问题,我只是给了你代码背后的问题嗯,是我的错,我没有尝试!你的代码实现了我想要的!非常感谢。