Python 如何在scanpy中更改字体大小

我正在使用

scanpy

生成点图，无法更改字体大小。有没有办法做到这一点

例如，如何编辑这行代码

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sc.pl.dotplot（df，[“基因”]，'CellType'，dendrogram=True，save=name）

IIRC，scanpy只在引擎盖下使用matplotlib，因此有几个选项：

您可以全局设置字体大小：

import matplotlib.pyplot as plt
plt.rcParams.update({'font.size': 'large'})

您只能专门更新（所有）轴标签的字体大小：

plt.rcParams.update({'axes.labelsize' : 'large'}) 
plt.rcParams.update({'axes.xtick.labelsize' : 'large'})   
plt.rcParams.update({'axes.ytick.labelsize' : 'large'})    

最后，如果有轴的控制柄，则可以通过遍历轴属性来更改标签的字体大小：

dp_object = sc.pl.dotplot(df,  ["gene"], 'CellType', dendrogram=True,  save = name)
axes_dict = dp_object.get_axes()
# figure out which axis you want by printing the axes_dict
# print(axes_dict)
ax = axes_dict[...]
ax.xaxis.label.set_fontsize(22)
for label in ax.get_xticklabels():
    label.set_fontsize('large')

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事实证明，您可以通过以下方式直接使用scanpy执行此操作：

sc.set\u figure\u参数（scanpy=True，fontsize=14）

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但是，我仍然不确定如何具体更改y轴…

我想你指的是plt.rcParams.update？第二段代码无法编译。不幸的是，第三个块在单独的绘图中生成更大的字体；我修正了打字错误。是的，我忽略了，由于

groupby

，您正在绘制多个组件。在这种情况下，您可以使用

dotplot\u对象访问轴。get\u axes

方法（显示在更新的答案中）。感谢您的评论。我得到的错误是：'NoneType'对象没有属性'get\u axes'运行dp\u对象。get\u axes（）。不知道如何解决，肯定花了不少时间试图解决这个问题…也许你的版本有问题？我很确定这个特性在某个时候起作用了（请参阅中的最后一个示例。我找到了它，非常感谢！事实证明您必须将return\u fig=True！