imread_collection（）加载模式（scikit图像Python）

我在使用

imread\u collection（）

从文件夹加载480张

.tif

图像时遇到问题（可能是我自己的错误）

我有一个包含480个映像的外部驱动器，因此每个映像的路径名为：

'D:\img_channel000_position000_time000000000_z000.tif', 
'D:\img_channel000_position000_time000000001_z000.tif', 
'D:\img_channel000_position000_time000000002_z000.tif'

等等。480个映像是外部驱动器上唯一的对象。我知道这是我成功使用的路径名

import skimage
from skimage import io

image = skimage.io.imread('D:\img_channel000_position000_time000000000_z000.tif')

导入图像并在我希望完成的分析中执行第一步。一、 可能很幼稚，然后尝试使用以下代码导入整个集合

import skimage
from skimage import io

ic = skimage.io.imread_collection('D:\*.tif')

---

但是，甚至从未创建变量

ic

。代码成功运行，没有错误，但什么也没有发生。这是我如何实现负载模式的问题吗？我还尝试了更完整的

D:\img\u channel000\u position000\u*\ u z000.tif

，但没有任何结果。任何建议都将不胜感激

正如@Juan在评论中指出的，问题可能是Linux和Windows使用不同的目录分隔符。使您的代码平台独立的一种可能方法是如下使用：

In [18]: import os

In [19]: from skimage import io

In [20]: external_drive = 'D:'

In [21]: file_spec = '*.tif'

In [22]: load_pattern = os.path.join(external_drive, file_spec)

In [23]: ic = io.imread_collection(load_pattern)

In [24]: ic
Out[24]: <skimage.io.collection.ImageCollection at 0x1f94f27f080>

In [25]: ic.files
Out[25]: ['D:\\img_001.tif', 'D:\\img_002.tif', 'D:\\img_003.tif']

[18]中的

：导入操作系统
In[19]：来自skimage import io
在[20]中：外部_驱动器='D:'
在[21]中：文件_spec='*.tif'
在[22]中：load\u pattern=os.path.join（外部\u驱动器，文件\u规范）
In[23]：ic=io.imread\u集合（加载模式）
In[24]：ic
出[24]：
In[25]：ic.files
输出[25]：['D:\\img_001.tif'，'D:\\img_002.tif'，'D:\\img_003.tif']

---

在使用Windows 10和Python 3.6.3（Anaconda）的机器上执行的测试。

正如@Juan在评论中指出的，问题可能是Linux和Windows使用不同的目录分隔符。使您的代码平台独立的一种可能方法是如下使用：

In [18]: import os

In [19]: from skimage import io

In [20]: external_drive = 'D:'

In [21]: file_spec = '*.tif'

In [22]: load_pattern = os.path.join(external_drive, file_spec)

In [23]: ic = io.imread_collection(load_pattern)

In [24]: ic
Out[24]: <skimage.io.collection.ImageCollection at 0x1f94f27f080>

In [25]: ic.files
Out[25]: ['D:\\img_001.tif', 'D:\\img_002.tif', 'D:\\img_003.tif']

[18]中的

：导入操作系统
In[19]：来自skimage import io
在[20]中：外部_驱动器='D:'
在[21]中：文件_spec='*.tif'
在[22]中：load\u pattern=os.path.join（外部\u驱动器，文件\u规范）
In[23]：ic=io.imread\u集合（加载模式）
In[24]：ic
出[24]：
In[25]：ic.files
输出[25]：['D:\\img_001.tif'，'D:\\img_002.tif'，'D:\\img_003.tif']

---

在使用Windows 10和Python 3.6.3（Anaconda）的计算机上执行的测试。

我没有要测试的Windows计算机，但我怀疑Windows路径（带反斜杠）和glob（scikit image用于查找文件）没有很好地交互。我建议使用

os.path.normpath（'D:/*.tif'）

，甚至只使用

'D:/*.tif'

或

/D/*.tif

。。。让我们知道这些对你是否有帮助！我没有要测试的windows机器，但我怀疑windows路径（带反斜杠）和glob（scikit映像用于查找文件）没有很好地交互。我建议使用

os.path.normpath（'D:/*.tif'）

，甚至只使用

'D:/*.tif'

或

/D/*.tif

。。。让我们知道这些对你是否有帮助！