Python 如何合并给定代码中的条件以生成用于马尔可夫建模的新代码？_Python_Pandas_If Statement_Lambda_Markov Chains

Python 如何合并给定代码中的条件以生成用于马尔可夫建模的新代码？

python pandas if-statement lambda

Python 如何合并给定代码中的条件以生成用于马尔可夫建模的新代码？,python,pandas,if-statement,lambda,markov-chains,Python,Pandas,If Statement,Lambda,Markov Chains,在以下数据（d1_组）中，我尝试运行马尔可夫模型： contig pos M1 M2 Mk Mg1 F1 F1_PG F1_block S1 Sk1 S2 Sj 2 16230484 G/G G/G G/G G/G G|T 0|1 255 T/T T/T T/T T/T 2 16230484 G/G G/G G/G G/G G|T 0|1 255 T/T T/T T/T T/T 2 16230491 C/C C/C C/C C/C C|T 0

在以下数据（d1_组）中，我尝试运行马尔可夫模型：

contig  pos M1  M2  Mk  Mg1 F1  F1_PG   F1_block    S1  Sk1 S2  Sj
2   16230484    G/G G/G G/G G/G G|T 0|1 255 T/T T/T T/T T/T
2   16230484    G/G G/G G/G G/G G|T 0|1 255 T/T T/T T/T T/T
2   16230491    C/C C/C C/C C/C C|T 0|1 255 T/T T/T .   T/T
2   16230503    T/T T/T T/T T/T T|T 0|1 255 T/T T/T .   T/T
2   16230524    T/T T/T T/T T/T T|A 0|1 255 A/A A/A A/A A/A
2   16230535    .   .   .   .   T|C 0|1 255 .   .   .   .
2   16232072    A/A A/A A/A A/A A|G 0|1 255 G/G G/G G/G G/G
2   16232072    A/A A/A A/A A/A A|G 0|1 255 G/G G/G G/G G/G
2   16229767    T/T T/T T/T G/T C|T 1|0 726 .   T/C T/C T/C
2   16229767    T/T T/T T/T G/T C|T 1|0 726 .   T/C T/C T/C
2   16229783    C/C C/C C/C A/C G|C 0|1 726 G/C G/C G/C C|G
2   16229992    A/A A/A A/A G/A G|A 1|0 726 A/A A/A A/A A|G
2   16230007    T/T T/T T/T A/T A|T 1|0 726 A|T A|T A|T A|T
2   16230011    G/G G/G G/G G/G C|G 1|0 726 G/C C|G C|G G/C
2   16230049    A/A A/A A/A A/A T|A 1|0 726 A|T .   A/T A/T
2   16230174    .   .   .   C/C T|C 1|0 726 C|T T|C T|C C|T
2   16230190    A/A A/A A/A A/A T|A 1|0 726 T|G G|T T|G T|G
2   16230260    A/A A/A A/A A/A G|A 1|0 726 G/G G/G G/G G/G
2   16230260    A/A A/A A/A A/A G|A 1|0 726 G/G G/G G/G G/G
2   16232769    A/A A/A A/A A/A T|A 1|0 1335    T/T T/T T/T T/T
2   16232769    A/A A/A A/A A/A T|A 1|0 1335    T/T T/T T/T T/T
2   16232772    A/A A/A A/A A/A C|A 1|0 1335    C/C C/C C/C C/C
2   16232793    C/C C/C C/C C/C T|C 1|0 1335    T/T T/T T/T T/T
2   16232793    C/C C/C C/C C/C T|C 1|0 1335    T/T T/T T/T T/T
2   16232282    T/T T/T T/T T/T T|A 0|1 3353    A/A A/A A/A A/A
2   16232282    T/T T/T T/T T/T T|A 0|1 3353    A/A A/A A/A A/A
2   16232444    T/T T/T T/T T/T T|C 0|1 3353    C/C C/C C/C C/C
2   16232444    T/T T/T T/T T/T T|C 0|1 3353    C/C C/C C/C C/C

我运行以下代码：

import pandas as pd
do something to import the data in pd dataframe

d1_group.set_index('pos', inplace=True)
d2_list = d1_group.applymap(lambda c:[list(c)]) # this splits the values in each column

然后根据条件进行数据分析，

我正在根据数据的条件（即列值中有斜线与管道）获取

itertools产品

vs.

zip

所以总的来说有三个条件：

d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\
applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|')))

and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem.

         S1      Sk1       S2       Sj
pos                                                                

2   16230174    ....     C|T T|C T|C C|T
2   16230190    ....     T|G G|T T|G T|G

16230174  .... CgA,TgT      .        TgA,CgT    CgA,TgT
16230190  .... TgC,GgT   GgT,TgC     TgT,GgC    TgC,GgT

条件1:

d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\
applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|')))

and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem.

         S1      Sk1       S2       Sj
pos                                                                

2   16230174    ....     C|T T|C T|C C|T
2   16230190    ....     T|G G|T T|G T|G

16230174  .... CgA,TgT      .        TgA,CgT    CgA,TgT
16230190  .... TgC,GgT   GgT,TgC     TgT,GgC    TgC,GgT

如果c和shift（c）都包含管道（|），即d3_mm的代码，我正在尝试获取
c和shift（c）
的邮政编码
条件2:

d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem.

S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G

16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT
但是，如果c和/或shift（c）包含（/）我想要
itertools.product
即d2\u mm的代码
我需要合并d2_mm和d3_mm中的条件，从
开始，对于t in…
，还需要添加第三个条件
条件3:

d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem.

S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G

16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT
如果c和/或shift（c）包含句点（.）则该联接的输出只是一个句点，并不复杂
那么，如何在lambda函数中实现这一点呢？如果不是，没有
lambda的解决方案也可以。
我尝试了类似这样的方法： d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem. S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G 16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT 我还尝试使用另一个def函数，但使用c和shift（c）上的条件以及中的t 上的条件时，我遇到了一些复杂问题，然后如果
的话，会出现过多的
预期最终输出： d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem. S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G 16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT 拥有所有3-条件后我的所有列的预期输出将与此类似（如下），但每列将有4个产品或2个zip或句点，这取决于列值（用c表示）是否有斜线（/）或管道（|）或句点（.）：对于上述输出中未显示的列（给定输入位置的S1 Sj）输出为：输入： d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem. S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G 16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT 输出： d_mm = (d2_list+d2_list.shift(1)).dropna(how='all').\ applymap((lambda c: ','.join('g'.join(t) for t in it.product(*c) if '/' not in t if '/' in ''.join(map(str, c)) elif '|' in ''.join(map(str, c)) 'g'.join(t) for t in zip(*c) if '|' not in t if '|'))) and tried to put `elif` and `if ... not` in several different ways, but couldn't solve this nested loop problem. S1 Sk1 S2 Sj pos 2 16230174 .... C|T T|C T|C C|T 2 16230190 .... T|G G|T T|G T|G 16230174 .... CgA,TgT . TgA,CgT CgA,TgT 16230190 .... TgC,GgT GgT,TgC TgT,GgC TgC,GgT 谢谢， @Boud:谢谢，是的，我没有删除它。行。而且，我想做的与前面的几个问题并不完全相同，只是有些不同。不同问题的答案是不同的，我正在尝试将它们合并。在上一个问题中，我只需要得到itertools.product ，但在这个问题中itertools.product（*c）和zip（*c）使用c中的值和c中的条件依赖项。问题在于试图将这两个条件放在同一行代码上。我在修复此嵌套循环时遇到问题。迟早您必须告诉我们使用c 和正确定义的命名函数有什么困难：P@AndrasDeak：你看了我为d_mm试过的代码了吗？我想类似的东西会有用的。我尝试过将条件1和条件2放在一起，但不断出现错误。如果这两个条件可以放在同一行中，那么添加第三个条件就不难了。请加入我，我想弄清这个lambda难题的真相。我甚至不确定我是否理解您的输入，所以我们应该在聊天中澄清这一点。