Python 在Matplotlib中设置等高线子图的位置

我正在使用SciPy在CT图像中识别肿瘤。确定包含肿瘤的切片后，我使用以下方法检索切片：

slice_x, slice_y = ndimage.find_objects(label_im==label)[0]

然后，我将完整图像绘制如下：

plt.imshow(image, cmap='gray')

我想将提取的切片（包含肿瘤）的轮廓覆盖在原始图像的适当位置。但是，我无法使等高线图位于适当区域的顶部。相反，等高线图始终位于图像的左上角。以下是我正在使用的：

plt.contour(mask[slice_x, slice_y], position=(slice_x.start, \
slice_y.start), linewidths=2, colors='r')

结果如下：

---

如何设置等高线图在主图中的位置？谢谢

您需要使用

范围

关键字参数，而不是

位置

。但是，您需要指定最大值和起始值（即，它需要是

extent=[xmin，xmax，ymin，ymax]

）

在您的情况下，它看起来像：

extent=[xslice.start, xslice.stop+1, yslice.start, yslice.stop+1]
plt.contour(mask[xslice, yslice], extent=extent)

请注意，您可能需要使用

origin

关键字参数（或翻转ymin和ymax）来控制输入数据的解释方式

或者，您可以执行以下操作：

x, y = np.mgrid[xslice, yslice]
plt.contour(x, y, mask[xslcie, yslice])

如果你在一个大的区域工作，效率会有点低，但是会干净得多

作为后一种方法的完整示例：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.cm as cm

data = np.random.random((100,100))

xslice, yslice = slice(20, 30), slice(45, 65)

plt.imshow(data, cmap=cm.gray)

x, y = np.mgrid[xslice, yslice]
plt.contour(x, y, data[xslice, yslice])

plt.show()

---

您需要使用

范围

关键字参数，而不是

位置

。但是，您需要指定最大值和起始值（即，它需要是

extent=[xmin，xmax，ymin，ymax]

）

在您的情况下，它看起来像：

extent=[xslice.start, xslice.stop+1, yslice.start, yslice.stop+1]
plt.contour(mask[xslice, yslice], extent=extent)

请注意，您可能需要使用

origin

关键字参数（或翻转ymin和ymax）来控制输入数据的解释方式

或者，您可以执行以下操作：

x, y = np.mgrid[xslice, yslice]
plt.contour(x, y, mask[xslcie, yslice])

如果你在一个大的区域工作，效率会有点低，但是会干净得多

作为后一种方法的完整示例：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.cm as cm

data = np.random.random((100,100))

xslice, yslice = slice(20, 30), slice(45, 65)

plt.imshow(data, cmap=cm.gray)

x, y = np.mgrid[xslice, yslice]
plt.contour(x, y, data[xslice, yslice])

plt.show()

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谢谢，但运气不好。我能够使用

范围移动轮廓（最后！），但它从来没有位于正确的位置。我试过翻转Xs和Ys，原点='upper'，原点='lower'，原点='image'。这两种方法给出了相同（但不正确）的结果。知道为什么吗？没关系，明白了。我正在翻转slice_x和slice_y变量。非常感谢！谢谢，但是运气不好。我能够使用
范围移动轮廓（最后！），但它从来没有位于正确的位置。我试过翻转Xs和Ys，原点='upper'，原点='lower'，原点='image'。这两种方法给出了相同（但不正确）的结果。知道为什么吗？没关系，明白了。我正在翻转slice_x和slice_y变量。非常感谢！