Python 使用PIL TIFF标记从.tif图像元数据提取比例尺

我是Python新手，希望从电子显微镜（.tif）图像中提取比例信息

当我在记事本中打开文件并滚动到底部时，我看到一个标题“[Scan]”，下面有一个项目“PixelWidth=3.10059e-010”

我想在Python中读取该值，并将其用作测量图像中物理距离的校准因子

我发现使用PIL（）是一种很有前途的方法，但在运行推荐的代码时遇到了一个错误

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS

with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

我希望这会创建一个对象“meta_dict”，其中包含“PixelWidth”之类的字符串和“3.10059e-010”之类的浮动

相反，我看到：

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <module>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

  File "<ipython-input-62-4ea0187b2b49>", line 2, in <dictcomp>
    meta_dict = {TAGS[key] : img.tag[key] for key in img.tag.iterkeys()}

KeyError: 34682

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“”，第2行，在
meta_dict={TAGS[key]：img.tag[key]代表img.tag.iterkeys（）中的key
文件“”，第2行，在
meta_dict={TAGS[key]：img.tag[key]代表img.tag.iterkeys（）中的key
密钥错误：34682

---

很明显我做错了什么。任何帮助都将不胜感激。谢谢大家!

使用PIL，我认为使用for循环设置字典，然后打印所需结果会更清晰

from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS


with Image.open(imagetoanalyze) as img:
    meta_dict = {}
    for key in img.tag:      # don't really need iterkeys in this context
        meta_dict[TAGS.get(key,'missing')] = img.tag[key]

# Now you can print your desired unit:

print meta_dict["PixelWidth"]

---

如果您只需要一个值，还可以使用以下内容查找

PixelWidth

标记的编号：

for k in img.tag:
     print k,TAGS.get(k,'missing')

---

然后只需打印

img.tag[]

，而无需填充字典

您的文件可能是TIFF，TIFF标签34682中包含类似INI的元数据

尝试使用：

---

您正在扫描图像中的所有标记，

tags

没有

34682

的条目。这并不意味着您仍然无法取出

PixelWidth

标记，因为缺少的标记可能与您无关。您可以使用

TAGS.get（key）

而不是

TAGS[key]

来避免在未找到的键上崩溃，并使用如下所示的循环来确定要打印的值。谢谢！这消除了“KeyError:34682”，但给了我一个“meta_dict”对象，其中只有约10%的可用元数据值可由它们各自的键调用。剩下的90%可以通过在meta_dict['missing']中找到，在一个由“\r\”s分隔的大文本块中找到。所需的“PixelWidth”键恰好隐藏在此meta_dict['missing']text.Bummer中。很高兴

tiffile

解决方案为您提供了帮助。我还成功地使用

exiftool

进行了一般图像元数据提取，包括EM比例类型。我还想从蔡司显微镜上采集的图像中提取相同的校准因子。在这种情况下，在记事本中打开.tif文件不会显示可读文本。我希望通过一个简单的修改，从蔡司的图像中提取出与像素宽度相当的图像。浏览tiffile.py网页，看起来“tif.sem_metadata[…]”可能是实现这一点的方法。首先，我尝试：使用tiffile.tiffile（imagetoanalyze）作为tif:metadata=tif.sem_metadata“这将创建一个类型为“NoneType”的对象“metadata”“和1的大小。知道如何查看/提取蔡司元数据吗？请共享该文件。如果

sem\u metadata

返回None，则该文件不会被识别为蔡司sem图像。我的错误是：

sem\u metadata

实际上会提取图像元数据。看起来，我试图从中提取元数据的第一张蔡司图像可能已保存，但没有保存任何元数据。对于其他文件，

sem\u元数据

起作用。再次感谢！

import tifffile
with tifffile.TiffFile('FEI_SEM.tif') as tif:
    print(tif.fei_metadata['Scan']['PixelWidth'])