Python 如何将新列表附加到现有CSV文件？

我已经使用CSV writer从列表中创建了一个CSV文件。我想将另一个通过for循环创建的列表以列方式附加到CSV文件中

创建CSV文件的第一个代码如下：

with open("output.csv", "wb") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(master_lst):
        writer.writerow(row)

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG
sample1
3
3
1
sample2
4
4
1

read                         sample1     sample2
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC         3            4
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC         3            4
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG         1            1

我使用list

master\lst

创建了CSV文件，输出如下：

with open("output.csv", "wb") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(master_lst):
        writer.writerow(row)

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG
sample1
3
3
1
sample2
4
4
1

read                         sample1     sample2
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC         3            4
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC         3            4
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG         1            1

然后，我通过

for

循环创建另一个列表（

ind_lst

），列表的内容必须按列添加到上一步创建的CSV文件中。我使用了以下代码：

with open("output.csv", "ab") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(ind_lst):
        writer.writerow(row)

 infile= open(sys.argv[1], "r")
 lines = infile.readlines()[1:]
 master_lst = ["read"]
 for line in lines:
  line= line.strip().split(',')
  fourth_field = line [3]
  master_lst.append(fourth_field)

for file in files:
 ind_lst = []   
 if file.endswith('.fa'):
  first = file.split(".")
  first_field = first [0]
  ind_lst.append(first_field)
  fasta= open(file)
  individual_dict= {}
  for line in fasta:
   line= line.strip()
   if line == '':
    continue
   if line.startswith('>'):
    header = line.lstrip('>')
    individual_dict[header]= ''
   else:
    individual_dict[header] += line
 for i in master_lst[1:]:
   a = 0
   if key in individual_dict.keys():
     a = individual_dict[key]
   else:
    a = 0
   ind_lst.append(a)

我得到的结果如下：

with open("output.csv", "wb") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(master_lst):
        writer.writerow(row)

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG
sample1
3
3
1
sample2
4
4
1

read                         sample1     sample2
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC         3            4
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC         3            4
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG         1            1

但是，我需要如下列式输出：

with open("output.csv", "wb") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(master_lst):
        writer.writerow(row)

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG
sample1
3
3
1
sample2
4
4
1

read                         sample1     sample2
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC         3            4
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC         3            4
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG         1            1

我检查了解决方案，但只能找到按行追加的解决方案，但我需要按列追加：

我使用了

writer.writerows

而不是

writer.writerow

，但我得到了以下错误：

\u csv.Error:应为序列

输出如下：

read
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC
ACGGCUACCUUCACUGCCACCC
AGGCAGUGUGGUUAGCUGGUUG
s                        a   m   p  l  e 1

如您所见，它在每个单元格中打印列表的第一个元素，并在其后以错误终止。我是python的初学者，所以如果有人能帮助解决这个问题，那就太棒了

编辑：

主程序使用以下代码创建：

with open("output.csv", "ab") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(ind_lst):
        writer.writerow(row)

 infile= open(sys.argv[1], "r")
 lines = infile.readlines()[1:]
 master_lst = ["read"]
 for line in lines:
  line= line.strip().split(',')
  fourth_field = line [3]
  master_lst.append(fourth_field)

for file in files:
 ind_lst = []   
 if file.endswith('.fa'):
  first = file.split(".")
  first_field = first [0]
  ind_lst.append(first_field)
  fasta= open(file)
  individual_dict= {}
  for line in fasta:
   line= line.strip()
   if line == '':
    continue
   if line.startswith('>'):
    header = line.lstrip('>')
    individual_dict[header]= ''
   else:
    individual_dict[header] += line
 for i in master_lst[1:]:
   a = 0
   if key in individual_dict.keys():
     a = individual_dict[key]
   else:
    a = 0
   ind_lst.append(a)

ind_lst是使用以下代码创建的：

with open("output.csv", "ab") as f:
    writer = csv.writer(f)
    for row in zip(ind_lst):
        writer.writerow(row)

 infile= open(sys.argv[1], "r")
 lines = infile.readlines()[1:]
 master_lst = ["read"]
 for line in lines:
  line= line.strip().split(',')
  fourth_field = line [3]
  master_lst.append(fourth_field)

for file in files:
 ind_lst = []   
 if file.endswith('.fa'):
  first = file.split(".")
  first_field = first [0]
  ind_lst.append(first_field)
  fasta= open(file)
  individual_dict= {}
  for line in fasta:
   line= line.strip()
   if line == '':
    continue
   if line.startswith('>'):
    header = line.lstrip('>')
    individual_dict[header]= ''
   else:
    individual_dict[header] += line
 for i in master_lst[1:]:
   a = 0
   if key in individual_dict.keys():
     a = individual_dict[key]
   else:
    a = 0
   ind_lst.append(a)

---

您需要将

read

、

sample1

和

sample2

中的数据合并成一行

假设这些是可编辑的，您可以使用

zip

组合它们：

for row in zip(read, sample1, sample2):
    writer.writerow(row)

---

实际上，您正在尝试将多个列附加到现有文件中，即使这些新列的数据都存储在单个列表中。最好以不同的方式排列

索引中的数据。但是，由于您还没有演示如何实现这一点，下面的代码与您的问题中的格式一致

由于修改CSV文件很棘手，因为它们实际上只是文本文件，因此只需使用合并的数据创建一个新文件，然后在删除原始文件后重命名该文件以匹配原始文件（您现在已收到警告）

创建后进行更新的文件内容：

read，sample1，sample2
ACACCUGGGCUCUCCGGGUACC，3,4
ACGGCUAccuCuGCCACCC，3,4
aggcaguguguguguguggug，1,1
我想样本1和样本2不适合。示例1和示例2是通过for循环创建的列表。列表ind_lst应在每个for循环后变为空，以便容纳要创建和追加的新列表。这个问题还有其他解决方案吗？@rex没有。如果需要多列，您必须为一行创建一个iterable。请提出您的问题并添加定义
master_iist
的代码，更重要的是，为
for
循环创建
ind_lst
@martineau:Hi martineau，我已经更新了你的信息requested@martineau当前位置我正在查看答案部分，没有看到您的上述评论。很抱歉，我没有清楚地解释我的问题：（ind_lst是为当前工作目录中扩展名为.fa的每个文件创建的，ind_lst的内容必须以列方式追加到输出CSV文件中。因此，所有的.fa文件都会被读取，ind_lst会被创建并以列方式追加。在这个示例中，我提供了2个.fa文件，用于通过for循环whic创建ind_lst。）h必须按列添加。如果您有任何问题，并且我的问题仍然不清楚，请告诉我。雷克斯：好的举措。但是，我厌倦了等待您这样做，并根据当时的内容尽我所能回答了您的问题。您可能可以稍微简化我回答中的内容，即重新排列代码的部分>ind_lst

-通过创建

ind_lst

，使其成为一个列表列表，其中每个子列表中的第n个元素来自每个fasta文件。如果您不知道如何做，那么是时候问另一个问题了。雷克斯：谢谢。对于一个不相关的问题，可以帮助您从多个fasta文件中创建

ind_lst

将同时打开并被读取（提示）。