Python 以自动化方式获取蛋白质单体

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对于pdb数据库中给定的一组pdb格式的蛋白质结构,我想找到一些自动化的方法来检查每个结构是否为单体、二聚体、三聚体等,因此我只得到每种情况下的单元结构或单体。我开始研究biopython,但我不确定是否还有其他方法可以做到这一点。

看来第一步是访问PDB数据库。我不熟悉biopython,但从文档来看,它似乎只有以下内置数据库连接器:

  • 出口
  • SCOP
  • NCBI的Entrez(和Pubmed)
您知道如何连接到PDB数据库吗