Python Numexpr没有';t识别浮点型(稀疏矩阵)
我想在python(2.7)中评估numexpr模块的性能。为此,我创建了一个大小为(10^5,10^5)的随机稀疏矩阵。但是,下面的脚本已经在表达式求值步骤中抛出了一个错误,表示它无法识别对象类型 我做错了什么 代码: 错误: 回溯(最近一次呼叫最后一次):Python Numexpr没有';t识别浮点型(稀疏矩阵),python,python-2.7,numpy,timeit,numexpr,Python,Python 2.7,Numpy,Timeit,Numexpr,我想在python(2.7)中评估numexpr模块的性能。为此,我创建了一个大小为(10^5,10^5)的随机稀疏矩阵。但是,下面的脚本已经在表达式求值步骤中抛出了一个错误,表示它无法识别对象类型 我做错了什么 代码: 错误: 回溯(最近一次呼叫最后一次): 文件“benchmark_expressmath.py”,第19行,在 ne.评估(‘总和(测试矩阵,轴=1)’) 文件“C:\Users\blahblah\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\sit
文件“benchmark_expressmath.py”,第19行,在
ne.评估(‘总和(测试矩阵,轴=1)’)
文件“C:\Users\blahblah\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site packages\numexpr\necompiler.py”,第756行,在评估中
签名=[(名称,getType(arg)),用于zip中的(名称,arg)(名称,参数)]
文件“C:\Users\blahblah\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site packages\numexpr\necompiler.py”,第654行,在getType中
提升值错误(“未知类型%s”%a.dtype.name)
ValueError:未知类型对象
numexpr
希望变量是numpy数组。它不处理scipy的稀疏矩阵。(例如,请参阅此电子邮件线程:)您知道有任何类似的Python包可以处理稀疏矩阵吗?有Pyparse,但我没有尝试过,我不知道它的性能与scipy相比如何。Pyparse没有类似numexpr的功能。@pv.,不,我不这么认为,但是,如果OP调查numexpr的原因是为了提高性能,并且如果Pyparse比scipy快得多,那么对numexpr的需求就会减少。
import timeit
import scipy.sparse as sps
import numpy as np
import numexpr as ne
test_matrix = sps.rand(1e4, 1e4, density=0.01, format='coo', dtype = np.float32)
ne.evaluate('sum(test_matrix, axis = 1)')
setup = 'import numexpr as ne; import numpy as np'
print min(timeit.Timer('ne.evaluate(sum(test_matrix, axis = 1))', setup=setup).repeat(7, 1000))
File "benchmark_expressmath.py", line 19, in <module>
ne.evaluate('sum(test_matrix, axis = 1)')
File "C:\Users\blahblah\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\numexpr\necompiler.py", line 756, in evaluate
signature = [(name, getType(arg)) for (name, arg) in zip(names, arguments)]
File "C:\Users\blahblah\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\numexpr\necompiler.py", line 654, in getType
raise ValueError("unknown type %s" % a.dtype.name)
ValueError: unknown type object