R 通过有效矩阵或手动方式显示紧凑的字母

我在R中运行多对比较。我使用生存包survminer。我正在使用以下函数： 成对_survdiff{survminer}

它给出了两两比较的显著性，但似乎没有办法给出结果的紧凑字母显示（CLD）。我在看一对19个关卡。最后，我把结果打印出来，手工输入excel，然后手工写信。但现在我需要再做一次，我希望有一个更简单的方法

我可以让R直接从成对的_survdiff{survminer}结果中执行CLD吗

暴露

有没有办法让it部门将结果打印到一个可以被电子表格读取的表格中

如果我手工制作逻辑矩阵，我如何让R将其转化为CLD

4）如果我是手工完成的，我想知道是否有一种更简洁的方法来显示这个比较列表。由于冗余，我可以消除这些字母中的任何一个吗？

---

谢谢

以下是来自

survminer

library(survminer)
library(multcomp)
library(tidyr)
data(myeloma)

res <- pairwise_survdiff(Surv(time, event) ~ molecular_group,
                         data = myeloma)

然后我们可以将

res

对象中的p值重新排列到矩阵中

mycomps

是成对比较的两侧矩阵。

signif

向量符合逻辑，指示差异是否显著

comps <- as_tibble(res$p.value, rownames="row") %>% 
  pivot_longer(-row, names_to="col", values_to="p") %>% 
  na.omit()
mycomps <- as.matrix(comps[,1:2])
signif <- comps$p < .05

comps <- as_tibble(res$p.value, rownames="row") %>% 
  pivot_longer(-row, names_to="col", values_to="p") %>% 
  na.omit()
mycomps <- as.matrix(comps[,1:2])
signif <- comps$p < .05

multcomp:::insert_absorb(signif, 
                         decreasing=FALSE, 
                         comps=mycomps, 
                         lvl_order=lvl_order)
# $Letters
# MAF    Proliferation       Cyclin D-2            MMSET     Hyperdiploid 
# "ab"              "a"              "b"             "ab"              "b" 
# Low bone disease       Cyclin D-1 
# "ab"             "ab" 
# 
# $monospacedLetters
# MAF    Proliferation       Cyclin D-2            MMSET     Hyperdiploid 
# "ab"             "a "             " b"             "ab"             " b" 
# Low bone disease       Cyclin D-1 
# "ab"             "ab" 
# 
# $LetterMatrix
# a     b
# MAF               TRUE  TRUE
# Proliferation     TRUE FALSE
# Cyclin D-2       FALSE  TRUE
# MMSET             TRUE  TRUE
# Hyperdiploid     FALSE  TRUE
# Low bone disease  TRUE  TRUE
# Cyclin D-1        TRUE  TRUE
# 
# $aLetters
# [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r" "s" "t" "u" "v"
# [23] "w" "x" "y" "z" "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "L" "M" "N" "O" "P" "Q" "R"
# [45] "S" "T" "U" "V" "W" "X" "Y" "Z"
# 
# $aseparator
# [1] "."
# 
# attr(,"class")
# [1] "multcompLetters"