r脚本从终端缓慢运行

最近我为实验室写了一个R脚本

a=system（cmd，wait=T，intern=T）

在一个循环中。它从终端调用一些工具。我在终端上运行了它

sudo Rscript mycode.R

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问题在于，它在4GB RAM、1cpu笔记本电脑中的运行速度与16GB RAM、12CPU PC中的运行速度相同。当它在PC上运行时，它只使用1.6GB的RAM和一个100%的CPU。PC是Ubuntu 16.04。我怎样才能使它更快？这只是R强加的限制吗？提前谢谢。

我解决了这个问题！实际上，第二条评论引导我找到了解决方案。我的工作是做一些生物信息学分析。事实证明，输入文件可以拆分为多个部分。我将其拆分，然后使用GNU parallel运行并行命令。谢谢大家!

可能的副本谢谢！我怎样才能改变这一点？我猜这与从RIt设置限制不同，听起来你的代码（1）没有并行化，（2）只需要1.6GB的RAM。从（2）中可以看出，运行此脚本时，4GB的RAM与16GB的RAM对性能没有影响。从（1）中可以看出，如果CPU之间的单核性能相同，那么12核与1核的对比不会提高性能。如果您的代码可以从并行化中获益，那么您可以通过这种方式加快PC机上的执行速度。一个关于如何并行的示例。谢谢@duckmayr！你的评论把我引向正确的方向