R：交互式RcppGSL使用

我试图在64位Windows机器上使用

RcppGSL

，但感觉

make

变量的一些细微差别我不理解

以下是我尝试过的：
1.从二进制文件安装GSL，该二进制文件位于我在顶级R安装目录中创建的新目录中。
2.更新了环境变量以包含一个新变量

LIB_GSL

，该变量指向我解压缩GSL的文件夹。
3.在新目录中创建一组文件：
-示例1.cpp
-马克瓦尔斯·温

下面是每个文件的外观

例1.cpp

example1.cpp

文件是基本列规范函数，作为示例包含在

RcppGSL

包本身中：

// [[Rcpp::depends(RcppGSL)]]
#include <RcppGSL.h>
#include <gsl/gsl_matrix.h>
#include <gsl/gsl_blas.h>

// [[Rcpp::export]]
Rcpp::NumericVector colNorm(Rcpp::NumericMatrix sM) {

    RcppGSL::matrix<double> M(sM);   // create gsl data structures from SEXP
    int k = M.ncol();
    Rcpp::NumericVector n(k);       // to store results 

    for (int j = 0; j < k; j++) {
        RcppGSL::vector_view<double> colview = gsl_matrix_column (M, j);
        n[j] = gsl_blas_dnrm2(colview);
    }

    M.free();       // important: GSL wrappers use C structure
    return n;               // return vector  
}

问题: 但是，当我

sourceCpp

查看

example1.cpp

文件时，它会给出以下输出：

> Rcpp::sourceCpp('example53[RcppGSL].cpp')
g++ -m64 -I"F:/PROGRA~1/r/R-31~1.1/include" -DNDEBUG -IF:/programming/r/R-3.1.1/GSL/include     -I"F:/programming/r/R-3.1.1/library/Rcpp/include" -I"F:/programming/r/R-3.1.1/library/RcppGSL/include"  -I"d:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/include"     -O2 -Wall  -mtune=core2 -c example53[RcppGSL].cpp -o example53[RcppGSL].o
g++ -m64 -shared -s -static-libgcc -o sourceCpp_9705.dll tmp.def example53[RcppGSL].o -LF:/programming/r/R-3.1.1/GSL/lib -lgsl -lgslcblas -LF:/PROGRA~1/r/R-31~1.1/bin/x64 -lRlapack -LF:/PROGRA~1/r/R-31~1.1/bin/x64 -lRblas -lgfortran -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib/x64 -Ld:/RCompile/CRANpkg/extralibs64/local/lib -LF:/PROGRA~1/r/R-31~1.1/bin/x64 -lR
f:/programming/r/rtools/gcc-4.6.3/bin/../lib/gcc/i686-w64-mingw32/4.6.3/../../../../i686-w64-mingw32/bin/ld.exe: cannot find -lgsl
f:/programming/r/rtools/gcc-4.6.3/bin/../lib/gcc/i686-w64-mingw32/4.6.3/../../../../i686-w64-mingw32/bin/ld.exe: cannot find -lgslcblas
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("example53[RcppGSL].cpp") : 
  Error occurred building shared library.

现在，我知道我的文件实际上是

-L$（LIB\u GSL）/LIB/x64

，但链接器正在查找

-L$（LIB\u GSL）/LIB

（这也反映在我的

Makevars.win

中），因此无法找到

libgsl

或

libgslcblas

。我如何强制这是传递给

cppSource

的

PKG_LIBS

，而不是默认值

---

我目前的解决方法是将

-L$（LIB\u GSL）/LIB/x64

中的所有内容复制到

-L$（LIB\u GSL）/LIB

，但对该解决方案不满意

sourceCpp（）不使用

Makevars.win

当我在Linux上执行此操作时，一切正常：

R> sourceCpp("/tmp/coln.cpp")   # where coln.cpp is what you have above
R> colNorm(matrix(1:16,4,4))
[1]  5.47723 13.19091 21.11871 29.08608
R> 

Windows上使用的内容是在包加载时通过包源中的文件

R/inline.R

确定的，它反映了

LIB\u GSL

的内容

---

也许行

gsl_libs是这样的，Windows二进制软件包没有源代码（可能是您让我查看“library/RcppGSL/R/”）。我将尝试下载源代码并进行编辑。另外，
install\u github（“eddelbuettel/rcppgsl”）
在Windows上出现了一个非常奇怪的错误；不要使用devtools，因为我有一个github repo。您也可以使用已发布的CRAN源，尽管现在似乎没有什么不同。
R> sourceCpp("/tmp/coln.cpp")   # where coln.cpp is what you have above
R> colNorm(matrix(1:16,4,4))
[1]  5.47723 13.19091 21.11871 29.08608
R>