R 依赖矩阵

R 依赖矩阵,r,chi-squared,R,Chi Squared,我需要用我的数据集的所有91个变量建立一个依赖关系矩阵 我试图使用一些代码,但没有成功 这里是重要代码的一部分: p<- length(dati) chisquare <- matrix(dati, nrow=(p-1), ncol=p) 除非在最后一列中似乎有p值,否则所有单元格按行显示相同的值 我还尝试了另一种方法,这是由比我更了解如何管理R的人提供的: #strange values I have in some columns sum(dati == 'x') #repl

我需要用我的数据集的所有91个变量建立一个依赖关系矩阵

我试图使用一些代码,但没有成功

这里是重要代码的一部分:

p<- length(dati)
chisquare <- matrix(dati, nrow=(p-1), ncol=p)
除非在最后一列中似乎有p值,否则所有单元格按行显示相同的值

我还尝试了另一种方法,这是由比我更了解如何管理R的人提供的:

#strange values I have in some columns
sum(dati == 'x')

#replacing "x" by x
x <- dati[dati=='x']

#distribution of answers for each question
answers <- t(sapply(1:ncol(dati), function(i) table(factor(dati[, i], levels = -2:9), useNA = 'always')))

rownames(answers) <- colnames(dati)
answers
#correlation for the pairs

I<- diag(ncol(dati)) 
#empty diagonal matrix

colnames(I) <- rownames(I) <- colnames(dati)
rn <- rownames(I)
cn <- colnames(I)

#loop
system.time({
    for(i in 1:ncol(dati)){
        for(j in 1:ncol(spain)){
            a <- dati[, rn[i]]
            b <- dati[, cn[j]]
            r <- chisq.test(a,b)$statistic
            r <- chisq.test(a,b)$p.value
            I[i, j] <- r
        }
     }
})

 user  system elapsed 
  29.61    0.09   30.70 

There are 50 and more alerts (use warnings() to read the first 50)

warnings() #let's check
-> : In chisq.test(a, b) : Chi-squared approximation may be incorrect

diag(I)<- 1

#result
head(I)
列在第5个变量处停止,而我需要检查所有变量之间的依赖关系。每一个

我不明白我错在哪里,但我希望我不会走得太远


我希望能得到您的帮助。

您显然是在试图计算卡方检验的p值, 对于数据集中的所有变量对。 这可以按如下方式进行

# Sample data
n <- 1000
k <- 10
d <- matrix(sample(LETTERS[1:5], n*k, replace=TRUE), nc=k)
d <- as.data.frame(d)
names(d) <- letters[1:k]

# Compute the p-values
k <- ncol(d)
result <- matrix(1, nr=k, nc=k)
rownames(result) <- colnames(result) <- names(d)
for(i in 1:k) {
  for(j in 1:k) {
      result[i,j] <- chisq.test( d[,i], d[,j] )$p.value
  }
}
此外,您的数据可能有问题, 导致你收到警告, 但我们对此一无所知

您的代码有太多问题,我无法尝试枚举它们 您开始尝试创建一个具有不同数字的方阵
行和列,然后我就完全迷路了。

你应该处理你的问题的格式…应该尝试使问题标题更具体,并放置更具代表性的标记,例如编程语言
#strange values I have in some columns
sum(dati == 'x')

#replacing "x" by x
x <- dati[dati=='x']

#distribution of answers for each question
answers <- t(sapply(1:ncol(dati), function(i) table(factor(dati[, i], levels = -2:9), useNA = 'always')))

rownames(answers) <- colnames(dati)
answers
#correlation for the pairs

I<- diag(ncol(dati)) 
#empty diagonal matrix

colnames(I) <- rownames(I) <- colnames(dati)
rn <- rownames(I)
cn <- colnames(I)

#loop
system.time({
    for(i in 1:ncol(dati)){
        for(j in 1:ncol(spain)){
            a <- dati[, rn[i]]
            b <- dati[, cn[j]]
            r <- chisq.test(a,b)$statistic
            r <- chisq.test(a,b)$p.value
            I[i, j] <- r
        }
     }
})

 user  system elapsed 
  29.61    0.09   30.70 

There are 50 and more alerts (use warnings() to read the first 50)

warnings() #let's check
-> : In chisq.test(a, b) : Chi-squared approximation may be incorrect

diag(I)<- 1

#result
head(I)
# Sample data
n <- 1000
k <- 10
d <- matrix(sample(LETTERS[1:5], n*k, replace=TRUE), nc=k)
d <- as.data.frame(d)
names(d) <- letters[1:k]

# Compute the p-values
k <- ncol(d)
result <- matrix(1, nr=k, nc=k)
rownames(result) <- colnames(result) <- names(d)
for(i in 1:k) {
  for(j in 1:k) {
      result[i,j] <- chisq.test( d[,i], d[,j] )$p.value
  }
}