RStudio服务器和Microsoft R open:缺少环境变量

我在AmazonEC2上运行RStudio服务器（0.99.879），最近更新到MicrosoftR Open3.2.3（以前是Revolution R）。所有软件都在Ubuntu 14.04上运行

因为我想在所有shell会话中为所有用户提供我的Amazon访问密钥，所以我将它们放在

/etc/environment

中，比如

AWS\u access\u KEY=123

RStudio在用户

RStudio

下运行，我通过在RStudio中执行

system（“whoami”）

检查了该用户。在切换到Microsoft R Open[MRO]之前，

系统（“echo$AWS\u ACCESS\u KEY”）

（从RStudio执行）给出了正确的结果

123

。但现在它返回一个空字符串

但是，如果我通过

su-rstudio

在控制台中切换到user

rstudio

并从shell启动MRO，

系统（“echo$AWS\u ACCESS\u KEY”）

会给出正确的结果，这让我非常困惑

似乎只有RStudio和MRO才能使R忘记在

etc/environment

中定义的环境变量

你们知道这种奇怪行为的原因吗？有可能修复的指针吗？

我真的很想把钥匙放在一个地方（即

/etc/environment

），而且绝对不要硬编码在我的R代码中。我能想到的一个修复方法是从R中读取

/etc/environment

，提取

AWS\u ACCESS\u键

，并通过

Sys.setenv（）

进行设置。但这主要只是一个黑客，我想了解真正的问题是什么

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顺便说一句：也许我应该提到，我必须将R开始脚本中的

R_HOME_DIR

变量

/usr/bin/R

更改为

R_HOME_DIR=/usr/lib64/MRO-3.2.3/R-3.2.3/lib/R

，因为之前确定主目录的代码不适用于MRO。

请记住，RStudio服务器（开源版）不在登录shell下运行用户会话。因此，当您

su-rstudio

时，您将获得bash启动时初始化的shell变量

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谢天谢地，有一个非常简单的方法可以解决这个问题：symlink

R\u HOME/etc/Renviron.site

（请参阅）到

/etc/environment

。R的环境文件与Linux的格式相同（即KEY=VALUE），因此您可以向R和bash提供相同的环境初始值设定项列表。

太好了！事实上，我认为这个问题非常具体，不太可能得到答案。但今天似乎是我的幸运日。：）既然常规R版本一切正常，我想这是一场革命（或微软）已经改变了启动程序中的某些内容。无论如何，为了防止有人感兴趣，这里是创建sudo ln-s/etc/environment/usr/lib64/MRO-3.2.3/R-3.2.3/lib/R/etc/Renviron.site链接的命令。人们可能不得不将最后一个路径更改为自己的特定MRO安装路径，但是.OMG完全忘记了我已经在

R\u HOME/etc/Rprofile.site

中为常规R编写了读取和处理

/etc/environment

的代码。所以，这个谜题就解决了：MRO还有另一个

Rprofile.site

文件，我没有在其中设置这些变量。但我会保留@Jonathan的解决方案，因为它更干净、更简单。