强制fread填充适当数量的列

Fread

from

data.table

包通常可以使用

fill=TRUE

开关处理不规则的表（在我的例子中是SAM文件），只需用NA填充“不完整”行。有时，如果列在表中出现较晚，则无法找到正确的最大列数，如本例所示：

> body = paste0(rep("1 2\n", 1000), collapse="")
> main = paste0(body, "1 2 3\n", body, collapse="")
> fread(main, fill=T)
Warning message:
In fread(main, fill=T) :
  Stopped early on line 1001. Expected 2 fields but found 3.
  Consider fill=TRUE and comment.char=. First discarded non-empty line: <<1 2 3>>

>body=paste0（rep（“12”，1000），collapse=”“）
>main=paste0（主体，“1 2 3\n”，主体，折叠=”）
>fread（干管，填料=T）
警告信息：
在fread中（主，填充=T）：
在第1001行很早就停了。应为2个字段，但找到3个。
考虑填充=真和注释.char =。第一个丢弃的非空行：

有没有办法强制

fread

使用

fill

选项的正确列数，在本例中为三列

目前，我只提取列数，填充第一行（使用

sed

），

fread

，然后删除填充。这将消除快速加载带来的任何好处

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与旧问题相关，请选择“填充”选项。

有一些突出的错误，如您发现的错误<在这种情况下，code>fread不应失败。