Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/64.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

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R 寻找两个图之间的相似性_R_Igraph - Fatal编程技术网

R 寻找两个图之间的相似性

R 寻找两个图之间的相似性,r,igraph,R,Igraph,我有两个图(g1)和(g2),两个图中的节点数和度数都不同。我想计算“在某种程度上”这两张图有多相似。 我认为在使用类似Jaccard索引的方法时,应该是这样的: g1 <- erdos.renyi.game(100, 0.3) g2 <- erdos.renyi.game(100, 0.3) g.union <- graph.union(g1, g2) g.intersect <- graph.intersection(g1, g2, keep.all.vertice

我有两个图(g1)和(g2),两个图中的节点数和度数都不同。我想计算“在某种程度上”这两张图有多相似。 我认为在使用类似Jaccard索引的方法时,应该是这样的:

g1 <- erdos.renyi.game(100, 0.3)
g2 <- erdos.renyi.game(100, 0.3) 
g.union <- graph.union(g1, g2)
g.intersect <- graph.intersection(g1, g2, keep.all.vertices=F)

sim.index <- ecount(g.intersect)/ecount(g.union)

g1
graph.union
graph.intersection
使用顶点标签,因此如果重新标记顶点(但没有更改图形的结构),您将得到不同的答案。如果需要依赖于结构而不是顶点标签的相似性度量,可以尝试前面讨论过的图形编辑距离。不幸的是,计算它是NP难的,而且在igraph中似乎没有实现。第6章《利用R进行实用图挖掘》(Samatova等)解释了Neuman核以及如何计算两个网络图的“相关性”。153-156上的示例使用了包igraph和ProximityMeasure。谢谢@lawyeR,我找不到的是包ProximityMeasure,我认为库GraphClusterAnalysis可以做类似的事情,但我也找不到。这是我所指的一章——你检查了吗?