R 是否有方法使用存在/不存在数据计算多个站点之间的差异梯度?
我一直在尝试根据存在或不存在的数据,在一个系列中为鱼类提出一个物种(dis)相似性度量,每个湖泊的值为1或0。从我的研究来看,使用Jaccard指数的多站点差异性指数似乎效果最好,因为每个湖泊的单个站点存在/不存在不需要嵌套或特殊的营业额警告。通过“BetaApart”计算R中的贝塔多样性,得出的总体值为0.86。现在我想为每个站点提供一个(dis)相似性值,然后我可以使用它作为一个连续变量插入RDA。是否有计算特定场地差异的方法?我能想到的最接近的方法是将所有地点的贝塔多样性=0.86,然后计算每个湖泊中存在的物种数量除以0.86,类似于使用临时的Jaccard指数公式。例如,场地1将为=(1/7)/0.86;虽然我不知道这是否违反了任何假设。下面是我使用的数据R 是否有方法使用存在/不存在数据计算多个站点之间的差异梯度?,r,indexing,genetics,R,Indexing,Genetics,我一直在尝试根据存在或不存在的数据,在一个系列中为鱼类提出一个物种(dis)相似性度量,每个湖泊的值为1或0。从我的研究来看,使用Jaccard指数的多站点差异性指数似乎效果最好,因为每个湖泊的单个站点存在/不存在不需要嵌套或特殊的营业额警告。通过“BetaApart”计算R中的贝塔多样性,得出的总体值为0.86。现在我想为每个站点提供一个(dis)相似性值,然后我可以使用它作为一个连续变量插入RDA。是否有计算特定场地差异的方法?我能想到的最接近的方法是将所有地点的贝塔多样性=0.86,然后计
Species1 Species2 Species3 Species4 Species5 Species6 Species7
Site 1 1 0 0 0 0 0 0
Site 2 1 1 0 0 0 0 1
Site 3 1 1 1 1 1 1 1
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任何反馈都将不胜感激。因为这似乎更像是一个统计问题,我鼓励您在交叉验证时回答这个问题:因为这似乎更像是一个统计问题,我鼓励您在交叉验证时回答这个问题: