如何将多个目录中的多个文件读入R进行处理?
我正在进行模拟研究,需要处理和保存几个文本文件的结果。我以这样的方式组织数据,其中有子目录,在每个子目录中,我需要处理并获得1000个数据文件的单独结果。在SAS中使用宏很容易做到这一点。然而,我对R还不熟悉,不知道该怎么做。下面是我正在努力实现的目标如何将多个目录中的多个文件读入R进行处理?,r,batch-file,R,Batch File,我正在进行模拟研究,需要处理和保存几个文本文件的结果。我以这样的方式组织数据,其中有子目录,在每个子目录中,我需要处理并获得1000个数据文件的单独结果。在SAS中使用宏很容易做到这一点。然而,我对R还不熟悉,不知道该怎么做。下面是我正在努力实现的目标 DATA Folder-> DC1 -> DC1R1.txt ... DC1R1000.txt DC2 -> DC2R1.txt ... DC2R1000.txt 任何帮助都将不胜感激 我现在不在配
DATA Folder-> DC1 -> DC1R1.txt ... DC1R1000.txt
DC2 -> DC2R1.txt ... DC2R1000.txt
任何帮助都将不胜感激 我现在不在配备R的计算机附近,但请阅读有关文件相关功能的帮助:
dir
功能将列出文件和目录。它有一个递归参数。
list.files
是dir
的别名。file.info
函数将告诉您(除其他外)路径是否为目录,并且file.path
将组合路径部分
basename
和dirname
函数也可能有用
请注意,所有这些函数都是矢量化的
现在在计算机上编辑,下面是一个示例:
# Make a function to process each file
processFile <- function(f) {
df <- read.csv(f)
# ...and do stuff...
file.info(f)$size # dummy result
}
# Find all .csv files
files <- dir("/foo/bar/", recursive=TRUE, full.names=TRUE, pattern="\\.csv$")
# Apply the function to all files.
result <- sapply(files, processFile)
#创建一个函数来处理每个文件
processFile您可以使用Perl的glob()
函数获取文件列表,并使用例如的接口将其发送到R 如果需要对每个文件运行相同的分析,则可以使用list.files(recursive=T)
一次性访问它们。这是假设您已经将工作目录设置为数据文件夹
。recursive=T
也列出子目录中的所有文件。文件名请尝试list.files
。谢谢大家的回复@Tommy…到目前为止,您的编码工作正常…祈祷吧…我有768个数据条件,每个条件下有1000个模拟文件。这需要一段时间来处理,所以我会在完成后给出一个状态。谢谢Ramnath。我从未列出过。文件,但会尝试一下。汤米的编码到目前为止还在工作。嗨,塔玛。我不熟悉Perl。我是一名统计学家,从来没有必要使用这种方法。虽然……我听说它很强大。