如何修复OutOfMemoryError（Java）：r中超出了GC开销限制？

我必须读取文件夹列表中的文件，并将数据保存在R中。 我对测试数据使用了下面的代码，它可以正常工作。当我对实际数据使用代码时 我得到这个错误
错误：OutOfMemoryError（Java）：超出GC开销限制 调用自：顶级

这就是我为测试数据所做的

parent.folder <- "C:/Users/sandesh/Desktop/test_R"
sub.folder <- list.dirs(parent.folder, recursive =TRUE)[-1]
file <- file.path(sub.folder, "sandesh1.xlsx")
library(xlsx)
library(plyr)
fun <- function(file) {
  df <- read.xlsx(file, sheetIndex=1)
}
df.big <- ldply(file, fun)

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parent.folder这是rJava中的一个典型问题。XLConnect文档中对此进行了回答，该文档还使用rJava以与xlsx库相同的方式连接到excel。我引述：

“这是因为XLConnect（与xlsx相同）需要将整个数据对象复制到JVM以便
要将其写入文件，JVM必须使用其内存大小的固定上限进行初始化
在这个数量上，您可以将参数传递给R的JVM，就像通过
rJava的选项支持：

options(java.parameters = "- Xmx1024m")

但是，请注意，当JVM初始化时，这些参数在每个R会话中只计算一次
-这通常是在您加载第一个使用Java支持的包之后，所以您应该尽早这样做
可能。”

如上所述，在加载任何库之前，请在脚本开头运行选项函数，如果您是通过Rstudio运行它，请确保在运行脚本之前重新启动它

另外，请注意，根据您试图解析的文件的大小，仍然无法确定此选项是否有效。
LyzandeR，谢谢您的回答。我按照您的建议使用了此选项，但仍然出现相同的错误。我发现了另一个名为openxlsx的包，我认为它对于依赖JVM的包（如xlsx或XLConnect）是一个不错的选择。因此，当我使用openxlsx包时，脚本在执行时不会生成错误消息。但是，由于某些原因，结果数据集完全不同。它们甚至与excel中的数据集不匹配。所以…我还在挠头。是的。我也犯了同样的错误，上面的方法确实有效，但我的一位同事无法用上面的方法解决它。这就是为什么我说它可能不起作用。显然，它只适用于少数情况，并且根据文件/java版本/r版本/计算机规格等。您也可以尝试xlsx库、gdata库或Rexcel库。检查。其中一个可能有效。通常，他们都使用Rjava。此外，如果您在32位机器上工作，这也是它失败的原因之一。