从R中较大的列联表导出列联表

我有一个由python语言制作的csv格式列联表，如下所示：

            case  control
disease_A    20    30 
disease_B    35    45
disease_C    42    52
disease_D    52    62

现在我想从这个列联表中导出2x2列联表，用R计算卡方值

我如何从上面的列联表中推导出一个2x2表格，如下所示：

            case  control
disease_A    20    30 
disease_D    52    62

这可能是一个新手问题，但我对R还是新手，我在其他任何地方都找不到解决方案

数据：

txt <-  "           case  control
disease_A    20    30 
disease_B    35    45
disease_C    42    52
disease_D    52    62"

---

txt如果
M
属于
表类

M <- structure(c(20, 35, 42, 52, 30, 45, 52, 62), .Dim = c(4L, 2L), .Dimnames = list(
c("disease_A", "disease_B", "disease_C", "disease_D"), c("case", 
"control")), class = "table")



xtabs(Freq~Var1+Var2,data= subset(as.data.frame(M,stringsAsFactors=F),
                   Var1%in% c("disease_A", "disease_D")))
           Var2
 Var1        case control
  disease_A   20      30
  disease_D   52      62

谢谢你的回答，你能解释一下为什么结尾有逗号吗？我试着不用它，但它不起作用@user3015703如果在数据帧上使用函数
[
而不使用逗号，它将返回指定的列。如果使用逗号，
[
的两个参数是行和列。例如，
dat[1:3，2:5]
将返回列2到5的前三行。
dat2 <- dat[rownames(dat) %in% c("disease_A", "disease_D"), ]
#           case control 
# disease_A   20      30
# disease_D   52      62

M <- structure(c(20, 35, 42, 52, 30, 45, 52, 62), .Dim = c(4L, 2L), .Dimnames = list(
c("disease_A", "disease_B", "disease_C", "disease_D"), c("case", 
"control")), class = "table")



xtabs(Freq~Var1+Var2,data= subset(as.data.frame(M,stringsAsFactors=F),
                   Var1%in% c("disease_A", "disease_D")))
           Var2
 Var1        case control
  disease_A   20      30
  disease_D   52      62

 M <- structure(list(case = c(20L, 35L, 42L, 52L), control = c(30L, 
 45L, 52L, 62L)), .Names = c("case", "control"), class = "data.frame", row.names =   c("disease_A", 
 "disease_B", "disease_C", "disease_D"))

 as.table(as.matrix(M[grep("A|D", rownames(M)),]))