如何在$R_LIBS_用户下快速复制/更新本地库？

假设

我安装的R版本是3.3.1

我的环境变量

$R_LIBS_USER

设置为

$HOME/my/R_lib/%V

；及

我有一个目录

$HOME/my/R_lib/3.3.1

，其中包含大量随时间推移而安装的软件包

现在我想把我的R版本升级到3.4.1，比如说

我正在寻找一种方便的方法，在新目录

$HOME/my/R_-lib/3.4.1

下安装新的软件包集合，这是我目前在

$HOME/my/R_-lib/3.3.1

下拥有的库的“3.4.1版本”

---

（依我看，我正在寻找一种类似于Python的

pip

安装程序的“冻结”选项的功能，本质上，它会产生将来必须给安装程序的输入，以复制当前的安装。）

您可以使用function

installed.packages

。即：

installed.packages(lib.loc = "$HOME/my/R_lib/3.3.1")

返回的对象包含大量信息（每个包

说明

文件中的大多数字段），但包的名称位于第一列。因此，类似于以下内容的内容应该可以起到作用：

inst <- installed.packages(lib.loc = "$HOME/my/R_lib/3.3.1")
install.packages(inst[,1], lib="$HOME/my/R_lib/3.4.1", dependencies=FALSE)

生物导体封装：

bioc <- inst[grepl("Bioconductor",inst$Maintainer),]
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite(pkgs=bioc$Packages)

git <- non_cran[grepl("github", non_cran$URL),]
install.packages("devtools")
library(devtools)
for(i in seq(nrow(git))){
    install_github(repo=gsub("http://github.com/","",git$URL[i]))
}

---

bioc我想您可以先将3.3.1目录复制到3.4.1，然后运行
update.packages（）
Maybe？除了其他优秀的答案之外，我个人的想法是将@plannapus answer中的
install.packages
替换为
p\u load
from
pacman
，因为它在语法、自动检查已安装/可用版本等方面具有各种优点，等等，关于bioconductor或GitHub软件包，等等？thc确实，我还没有想到这些，我会尽快添加一些东西，以抓住这些。
git <- non_cran[grepl("github", non_cran$URL),]
install.packages("devtools")
library(devtools)
for(i in seq(nrow(git))){
    install_github(repo=gsub("http://github.com/","",git$URL[i]))
}