ggplot和ggdendro:编写生成树状图并将其保存到pdf文件的函数时出现的问题
我将ggplot脚本包装成一个函数,如下所示。但是,运行此命令会给我错误消息,如 xy.coords(x,y,xlabel,ylabel,log)中出错: “x”是一个列表,但没有组件“x”和“y” 没有将这些脚本包装到函数中,它们就可以正常工作。因此,如何编写这种函数,使用ggplot生成树状图并将其保存到pdf中ggplot和ggdendro:编写生成树状图并将其保存到pdf文件的函数时出现的问题,r,ggplot2,R,Ggplot2,我将ggplot脚本包装成一个函数,如下所示。但是,运行此命令会给我错误消息,如 xy.coords(x,y,xlabel,ylabel,log)中出错: “x”是一个列表,但没有组件“x”和“y” 没有将这些脚本包装到函数中,它们就可以正常工作。因此,如何编写这种函数,使用ggplot生成树状图并将其保存到pdf中 nicedendro<-function(inputdat, outputfile){ library(ggdendro) library(ggplot2)
nicedendro<-function(inputdat, outputfile){
library(ggdendro)
library(ggplot2)
x <- read.table(inputdat, head=TRUE)
y <- 1-x
d <- as.dist(y,diag=FALSE,upper=FALSE)
hc <- hclust(d,"ave")
dhc <- as.dendrogram(hc)
ddata <- dendro_data(dhc,type="rectangle")
ddata$labels$text <- gsub("\\."," ",ddata$labels$text)
pdf(outputfile, width=30,height=35)
plot(ggplot(segment(ddata)) +
geom_segment(aes(x=x0,y=y0,xend=x1,yend=y1)) +
xlab(NULL) +
ylab(NULL) +
scale_x_discrete(limits=ddata$labels$text) +
opts(panel.grid.major = theme_blank()) +
opts(panel.grid.minor=theme_blank()) +
coord_flip())
dev.off()
}
nicedendro这是一个非常常见的问题:您必须使用print()
才能打印图形
d <- function(){
g1 <- qplot(...)
print(g1)
}
d这是一个非常常见的问题:您必须使用print()
才能打印图形
d <- function(){
g1 <- qplot(...)
print(g1)
}
d除了不调用print外,在ggplot对象上调用plot也有点神秘……这可能解释了OP所遇到的错误。我的印象是,对于ggplot2对象,plot(g1)
将被分派到print(g1)
。但我猜我错了,我得到了上面提到的错误消息。除了不调用print之外,在ggplot对象上调用plot也有点晦涩……这可能解释了OP得到的错误。我的印象是,对于ggplot2对象,plot(g1)
将被分派到print(g1)
。但我猜我错了,我得到了上面提到的错误消息。