R平行：错误“；找不到函数"；%do%"&引用；

这是一段R代码（函数“Kclust”），它试图使用库（doParallel）并行执行任务

result=foreach（r=rseq，.combine=c）%dopar%{
K=apply（D，1，函数（v）{sum（v=th）
如果（长度（C）>0）{
G=图的邻接（D[C，C]<2*r）
lab=簇（G，“弱”）
标签=（N+1）：（2*N）；标签[C]=实验室$membership
}
else标签=1:N
s=0
如果（分数）{
s=scorewprec（标签=labels，pts=pts，sds=sds，xlim=xlim，ylim=ylim，psd=psd，minsd=minsd，maxsd=maxsd，useplabel=useplabel，alpha=alpha，pb=pb）
}
列表（“比例”=r，“分数”=s，“阈值”=th，“标签”=标签）
}
}

代码在以下情况下运行良好：

R版本3.0.2（2013-09-25）-“飞盘航行”。 平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）

但是，如果我使用以下命令运行代码：

R版本3.2.3（2015-12-10）-“木制圣诞树”。 平台：x86_64-w64-mingw32/x64（64位）

我明白了

{：任务1失败-“找不到函数“%do%”时出错 呼叫：sappy->lappy->FUN->Kclust->%dopar%-> 停止执行

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有什么问题吗？

正如@Roland在他的评论中提到的，您必须将

foreach

包导出到各个工人。可以这样做：

result = foreach (r = rseq, .combine=c, .packages = c("foreach")) %dopar% {
  #some code...
  # now use the foreach function from the foreach package again
  foreach (th = thseq) %do% {
  #...
  }
}

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就像这样，您必须将所有使用过的库作为字符向量导出到workers。因此，我添加了

c（“packageA”、“packageB”、“etc.”）

foreach包尚未导出到workers。@Roland感谢您的评论。您能更具体一点吗？

result = foreach (r = rseq, .combine=c, .packages = c("foreach")) %dopar% {
  #some code...
  # now use the foreach function from the foreach package again
  foreach (th = thseq) %do% {
  #...
  }
}