R 如何在没有背景连接或标签的情况下绘制网络？佩加斯

我已经使用pegas包按照来自的说明制作了一个单倍型网络。它已成功打印，但如下图所示，所有连接标签都已打印，使图形具有拥挤的外观。我怎样才能去掉这些

plot(net, size = attr(net, "freq"), pie=ind.hap, fast = TRUE, legend=F, label=NULL, vertices.last=F)
legend('topleft', capitalize(colnames(ind.hap)), col=rainbow(ncol(ind.hap)), pch=20, cex=0.7)

您可能想试试：

plot(net, size = attr(net, "freq"), pie=ind.hap, fast = TRUE, legend=F, label=NULL, vertices.last=F), col=rainbow(ncol(ind.hap)), pch=20, cex=0.7)

这是没有图例（'topleft'，大写（colnames…）参数的代码

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这行吗？

我相信您可以通过在

plot（）调用中设置
threshold=0
来调整它，即：

plot(net, size = attr(net, "freq"), pie=ind.hap, fast = TRUE, legend=F, label=NULL, threshold = 0)

有关更多详细信息，请参阅
？pegas:：plot.haploNet的帮助。还请注意，您提到的帖子（）有一个错误，饼图的颜色错误（我对此发表了评论，并发布了更正的答案）。
图例（…）
函数位于单独的一行中。网络与图例无关。我将如何删除
顶点。最后一个
参数会产生警告，并且对图形没有明显的影响。我确实看到了问题的第二个答案，事实上我与第一个错误链接；感谢您的注意。我已经看到了把它标记为正确的。