如何在knitr源文件中使用命令行参数？

我有一个R脚本，它接受命令行参数，我想将这些参数转换为Rtex或Rnw文件，并使用如下命令：

knit('myScript.Rtex "-args arg1=a arg2=b"')

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但是我不知道如何将我的命令行参数放入myScript.Rtex[用于通过

args进行计算]您可以编写一个R脚本而不是bash脚本：

my_script_launcher.R
然后像这样启动它：

Rscript my_script_launcher.R foo bar

我也遇到了同样的问题，最后使用了以下命令（使用
make
）：

#设置参数
P1=某些参数
P2=其他一些参数
#最高目标
全部：report.html
#将标记转换为HTML
%.html:%.md
Rscript-e'require（markdown）；markdownToHTML（$感谢您的建议。我需要提供一个从bash调用的解决方案，其中包含从bash命令行传递的参数。因此，我想我将使用该bash实例的环境，并使用Sys.getenv（）获取所需的内容。这有点难看，但我需要继续。@jimdavies不清楚您想做什么。查看
knit
command，它期望类似于，…
knit（输入、输出，…）
这是我随
knitr
一起提供的shell脚本：但我不清楚您想对
--args执行什么操作--是否要将它们传递给
knit（）
，或者在计算中使用它们？在计算中使用它们。例如，如果我有一个从命令行运行的R脚本as@jimdavies如果你想澄清什么，请编辑你原来的帖子；这里的评论在写和读代码方面都有很大的限制
#!/bin/bash
if [ $# -ne 2 ];
  then ` echo "Usage: $0 refdir cmpdir" exit 1`
fi
export CSPP_VIIRS_EDR_REFERENCE_DIR=$1
export CSPP_VIIRS_EDR_COMPARISON_DIR=$2
script=$(dirname $0)'/viirs_edr_UseR_compare.Rnw'
R --slave --no-save --no-restore -e "require(knitr); knit('$script')" &> viirs_edr_UseR_compare.log
pdflatex viirs_edr_UseR_compare.tex
exit 0

library(knitr)
args <- commandArgs(TRUE)
if (length(args) < 2) stop("Bad args, usage refdir cmpdir")

refdir <- args[1]
cmpdir <- args[2]

knit2pdf('my_script.Rnw')

\documentclass{article}
\begin{document}
refdir=\Sexpr{refdir}
cmpdir=\Sexpr{cmpdir}
\end{document}

Rscript my_script_launcher.R foo bar

# set parameters
P1=some parameter
P2=some other parameter

# top target
all : report.html

# convert Markdown to HTML
%.html : %.md
    Rscript -e 'require(markdown);markdownToHTML("$<","$@")'

# knit Rmd passing parameters
%.md : %.Rmd
    Rscript -e 'param1<-$(P1);param2<-$(P2);require(knitr);knit("$<")'