在R包中导入mice函数时出错

我想在我的包中包含mice:：mice函数，以便对我的数据执行插补

我使用Roxygen列出导入

#' @param data dataset to be used for imputation
#' @importFrom dplyr select_
#' @importFrom mice mice complete
#' @return A list
#' @export
#' 
impute_data <- function(data, vars, seed)
{
     data_used <- select_(data,vars)
     mice_data <- complete(mice(data_used, seed = seed))
     return(mice_data)
}

我试图将错误中提到的所有函数添加到导入中，但对结果没有任何影响

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我错过了什么？我从未发现过这样的问题。

您忘记处理描述文件了！您只处理插补_数据。R

你的问题非常类似于：

我在那里给出了答案（请在发布任何问题之前搜索类似的问题）。对于您的情况：

首先，意识到你的

sessionInfo() 
getwd() # your R's working directory
.libPaths() # your R's library location

步骤0下载并安装必要的软件包：

library(roxygen2)
library(devtools)
library(digest)

步骤1将所有相关的“.R”文件（yourfunction1.R、yourfunction2.R、yourfunction3.R、impute_data.R）放入R的工作目录

步骤2在R的工作目录中创建包框架： 在运行以下命令之前，请确保R的工作目录中没有名为“yourpackage”的文件夹。（从驾驶室控制台）

运行

package.skeleton

后，将在R的工作目录中创建文件夹yourpackage

从Windows资源管理器中删除

读取并删除我的文件。

删除您的工作目录\yourpackage\man文件夹中的“yourpackage package.Rd”文件

（不要删除r'sWorkingDirectory\yourpackage\man文件夹中的“yourpackage.Rd”文件！）

第3步在“.R”文件（impute_data.R）序言的末尾，输入以下内容（如果您在第1步中没有这样做）：

其中VersionNumber是您正在使用的mice包的版本号。在RevolutionREnterprise的对象浏览器中，右键单击任意函数（来自您的软件包），即可找到版本号；并转到生成的.html帮助文件的底部。在这里，显示了软件包的版本号

在步骤2中，package.skeleton自动生成一个名称空间文件，其内容为：

exportPattern("^[[:alpha:]]+")

不要手动处理此命名空间文件

步骤5将您要创建的包（“您的包”）还原

在roxygenization之后，包的名称空间文件的内容将自动从
exportPattern（“^[：alpha:]+”）
转换为

# Generated by roxygen2: do not edit by hand

export(impute_data)
importFrom(mice,mice)
importFrom(mice,complete)

步骤6构建您的包：

（首先，从Windows资源管理器中删除R'sWorkingDirectoryFolder\yourpackage文件夹中的“src-i386”和“src-x64”文件夹（如果有）

（再次确保您的R'sWorkingDirectory\yourpackage\man文件夹中没有“yourpackage package.Rd”文件。如果有，请在生成之前将其删除）

步骤7安装软件包：

install("yourpackage")

第8步加载包并在包中运行函数，检查一切是否正常

library(yourpackage)
impute_data(a,b,1235) # "impute_data" is the function in the package "yourpackage"

步骤9检查您的软件包是否可加载到CRAN（综合R Archieve网络）（如果您想共享您的软件包）：

（首先，从Windows资源管理器中删除R'sWorkingDirectoryFolder\yourpackage文件夹中的“src-i386”和“src-x64”文件夹（如果有）

（再次确保您的R'sWorkingDirectory\yourpackage\man文件夹中没有“yourpackage package.Rd”文件。如果有，请在检查之前将其删除）

从DOS命令提示符：

Start–cmd–Enter。传递到R的工作目录（您的R的工作目录通过getwd（）已知）并执行CRAN检查：

cd C:\Users\User\Documents\Revolution
R CMD check yourpackage

从R的控制台：

devtools::check("C:/Users/User/Documents/Revolution/yourpackage")

您好，即使帖子比较老

最近，我遇到了同样的问题，并提出了解决方案
埃尔多安·切赫和米克克不为我工作。我通过主动加载mice包解决了这个问题，同时加载了我自己的包。有关更多详细信息，请咨询

除了软件包开发过程中所需的步骤外，我还建议：

第1部分：将鼠标添加到包描述文件中的
依赖项：
（非
导入：
）字段

Depends: mice (>= VERSIONNUMBER)

第2部分：在命名空间中使用
导入（鼠标）
（仅适用于
devtools:：check（）
）

第3部分：例如，使用
鼠标引用每个函数：

mice::mice(data, method="pmm")

嗨，我使用的是RStudio，所有这些东西要么是默认处理的，要么已经处理好了（我自己），很抱歉我忘了在问题中添加这个。这根本不起作用。但我找到了解决方案，显然，mice包要求您在文档中设置“@importMethodsFrom mice”。这将使它工作。小更正，显然我发现的解决方案没有工作。。。我发现了一个更好的解决方案，每次名称空间移动时都会引用。。老鼠：完成，老鼠：老鼠。不优雅，但它的工作。
install("yourpackage")

library(yourpackage)
impute_data(a,b,1235) # "impute_data" is the function in the package "yourpackage"

cd C:\Users\User\Documents\Revolution
R CMD check yourpackage

devtools::check("C:/Users/User/Documents/Revolution/yourpackage")

Depends: mice (>= VERSIONNUMBER)

import(mice)

mice::mice(data, method="pmm")