R 如何根据名称向量聚合列表中的矩阵？

我想根据存储在向量中的名称聚合（求和）列表中的矩阵。以下是一些示例数据：

lst <- list("111"=matrix(c(1, 0, 6, NA, 1, 0),
                              nrow = 1, byrow = T),
            "112"=matrix(c(6, 2, 2, 0, 3, NA),
                              nrow = 1, byrow = T),
            "113"=matrix(c(2, 3, 0, 0, 1, 1),
                         nrow = 1, byrow = T))
agg.nam <- c(111,113)

因此，第一个和第三个矩阵相加（na.rm=TRUE）

我首先尝试将agg.nam子集化：

lapply(lst, function(x) x[, which(names(x) %in% agg.nam)] )

---

但是我在这一点上已经失败了，没有聚合。

您可以使用以下命令将相关列表元素抓取到矩阵中：

do.call(rbind, lst[as.character(agg.nam)])
#      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
# [1,]    1    0    6   NA    1    0
# [2,]    2    3    0    0    1    1

然后只需调用

colSums

，使用

na.rm=TRUE

（感谢@docendodiscimus指出这种简化）：

如果矩阵有多行，上面的简化就不会真正起作用，下面的方法会更好：

# Grab relevant list elements
mats <- lst[as.character(agg.nam)]

# Replace any instance of NA with 0
mats <- lapply(mats, function(x) {  x[is.na(x)] <- 0 ; x  })

# Sum them up
Reduce("+", mats)
#      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
# [1,]    3    3    6    0    2    1

#获取相关列表元素
mats1）abind即使组成矩阵不是单行矩阵，该功能也有效
abind
从子列表
L
创建一个三维数组，然后使用
na.rm=TRUE
沿平行元素应用
sum

library(abind)

L <- lst[as.character(agg.nam)]
apply(abind(L, along = 3), 1:2, sum, na.rm = TRUE)

2）数组这也可以工作，不使用任何包。除了使用
array
将
L
重塑为3d数组外，其工作原理相同<代码>L

来自上方

make3d <- function(List) array(unlist(List), c(dim(List[[1]]), length(List)))
apply(make3d(L), 1:2, sum, na.rm = TRUE)

3a）第（3）项的变化是：

苏姆纳

library(abind)

L <- lst[as.character(agg.nam)]
apply(abind(L, along = 3), 1:2, sum, na.rm = TRUE)

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
[1,]    3    3    6    0    2    1

make3d <- function(List) array(unlist(List), c(dim(List[[1]]), length(List)))
apply(make3d(L), 1:2, sum, na.rm = TRUE)

psum <- function(x, y) array(mapply(sum, x, y, MoreArgs = list(na.rm = TRUE)), dim(x))
Reduce(psum, L)

sumNA <- function(...) sum(..., na.rm = TRUE)
array(do.call(mapply, c(sumNA, L)), dim(L[[1]]))