R 挖泥船MuMIn:在GLMM上使用挖泥船时,空模型是否包含随机效应?
我有一个全局模型,使用GLMM,有5个固定效应和交互作用,以及两个随机效应R 挖泥船MuMIn:在GLMM上使用挖泥船时,空模型是否包含随机效应?,r,data-modeling,information-theory,mumin,R,Data Modeling,Information Theory,Mumin,我有一个全局模型,使用GLMM,有5个固定效应和交互作用,以及两个随机效应 x ~ a*b + a*c + a*d + a*e + (1|f) + (1|g) 我使用的是信息论方法,并在此全局模型上使用了MuMIn中的druge()函数 空模型排名很低(95),我认为这意味着固定效应对系统很重要,因为有94种可能的模型组合比随机模型更好 然而,一位同事问,零模型中是否包括随机效应,否则,当然许多模型比零模型好,因为它们考虑了随机效应的变化,但零模型不会 然而,我假设模型仍然会有这些随机效应,只
x ~ a*b + a*c + a*d + a*e + (1|f) + (1|g)
我使用的是信息论方法,并在此全局模型上使用了MuMIn
中的druge()
函数
空模型排名很低(95),我认为这意味着固定效应对系统很重要,因为有94种可能的模型组合比随机模型更好
然而,一位同事问,零模型中是否包括随机效应,否则,当然许多模型比零模型好,因为它们考虑了随机效应的变化,但零模型不会
然而,我假设模型仍然会有这些随机效应,只是没有固定的效应。这是正确的吗?是的
这里有一个实验性的例子,druge()
只删除固定效果,将空模型保留为(截距+所有随机效果)
图书馆(lme4)
图书馆(MuMIn)
m1=lmer(反应天数+(天数|受试者),睡眠研究,na.行动=na.失败,REML=FALSE)
dd=挖泥船(m1)
固定术语为“(截取)”
##全球模型调用:lmer(公式=反应~天数+(天数|受试者),数据=睡眠研究,
##REML=FALSE,na.action=na.fail)
## ---
##选型表
##(国际)日对数AICc增量重量
## 2 251.4 10.47 6 -875.970 1764.4 0.0 1
## 1 257.8 5 -887.738 1785.8 21.4 0
##AICc排名的模型(x)
##随机项(所有型号):
##“天|主题”
这里的第一点是,打印输出的末尾明确显示了所有术语的随机效果
手动拟合空模型并将AICc与上表进行比较:
m0 <- update(m1, . ~ . - Days)
formula(m0)
## Reaction ~ (Days | Subject)
AICc(m0)
## [1] 1785.821
m0是
这里有一个实验性的例子,druge()
只删除固定效果,将空模型保留为(截距+所有随机效果)
图书馆(lme4)
图书馆(MuMIn)
m1=lmer(反应天数+(天数|受试者),睡眠研究,na.行动=na.失败,REML=FALSE)
dd=挖泥船(m1)
固定术语为“(截取)”
##全球模型调用:lmer(公式=反应~天数+(天数|受试者),数据=睡眠研究,
##REML=FALSE,na.action=na.fail)
## ---
##选型表
##(国际)日对数AICc增量重量
## 2 251.4 10.47 6 -875.970 1764.4 0.0 1
## 1 257.8 5 -887.738 1785.8 21.4 0
##AICc排名的模型(x)
##随机项(所有型号):
##“天|主题”
这里的第一点是,打印输出的末尾明确显示了所有术语的随机效果
手动拟合空模型并将AICc与上表进行比较:
m0 <- update(m1, . ~ . - Days)
formula(m0)
## Reaction ~ (Days | Subject)
AICc(m0)
## [1] 1785.821
m0